35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1175 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1186  chaperone-modulator protein CbpM  100 
 
 		 101 aa  204  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1070  chaperone-modulator protein CbpM  100 
 
 		 101 aa  204  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1175  chaperone-modulator protein CbpM  100 
 
 		 101 aa  204  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.585707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1221  chaperone-modulator protein CbpM  100 
 
 		 101 aa  204  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.874491 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1206  chaperone-modulator protein CbpM  100 
 
 		 101 aa  204  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.895073  normal  0.418844 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2643  chaperone-modulator protein CbpM  74.26 
 
 		 101 aa  159  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.813926  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01009  hypothetical protein  74.26 
 
 		 101 aa  159  9e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1235  chaperone-modulator protein CbpM  74.26 
 
 		 101 aa  159  9e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.589416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2315  chaperone-modulator protein CbpM  74.26 
 
 		 101 aa  159  9e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2125  chaperone-modulator protein CbpM  74.26 
 
 		 101 aa  159  9e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2596  chaperone-modulator protein CbpM  74.26 
 
 		 101 aa  159  9e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.370593 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01002  modulator of CbpA co-chaperone  74.26 
 
 		 101 aa  159  9e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1117  chaperone-modulator protein CbpM  74.26 
 
 		 101 aa  159  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1111  chaperone-modulator protein CbpM  74.26 
 
 		 101 aa  159  9e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3861  chaperone-modulator protein CbpM  67.33 
 
 		 101 aa  138  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.346166  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4847  hypothetical protein  43.88 
 
 		 101 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4725  hypothetical protein  43.88 
 
 		 101 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4904  hypothetical protein  41.67 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4639  hypothetical protein  39.58 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0672421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0578  hypothetical protein  40 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02200  hypothetical protein  39.8 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2099  hypothetical protein  30.3 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3022  hypothetical protein  36.46 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1816  hypothetical protein  36.78 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6321  hypothetical protein  34.88 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6287  hypothetical protein  37.18 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.518749  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6430  hypothetical protein  32.94 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.418737 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2344  MerR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3331  hypothetical protein  29.17 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426882  normal  0.549116 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0722  hypothetical protein  32.91 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0262  MerR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.143032  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1125  hypothetical protein  32.91 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.335532 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2218  hypothetical protein  26.74 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2131  MerR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.75658  normal  0.434651 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2190  hypothetical protein  26.74 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>