17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0617 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0617  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 113 aa  223  7e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0638  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 113 aa  223  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2983  MerR family transcriptional regulator  53.15 
 
 		 111 aa  100  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1427  MerR family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1430  MerR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1521  hypothetical protein  32.29 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3237  hypothetical protein  38.37 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3331  hypothetical protein  27.55 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426882  normal  0.549116 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0491  hypothetical protein  35.8 
 
 		 118 aa  43.5  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2221  MerR family regulatory protein  36.36 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.215829  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6321  hypothetical protein  29.79 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6287  hypothetical protein  32.95 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.518749  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0578  hypothetical protein  35.11 
 
 		 101 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1383  MerR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2131  MerR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 107 aa  40  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.75658  normal  0.434651 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1172  hypothetical protein  32.26 
 
 		 116 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.91443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02200  hypothetical protein  34.09 
 
 		 106 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>