22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6364 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6364  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  207  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.278619  normal  0.148278 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6185  hypothetical protein  80.37 
 
 		 107 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.426902 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3909  hypothetical protein  45.57 
 
 		 94 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1263  hypothetical protein  40.78 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0636838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0426  hypothetical protein  34.04 
 
 		 120 aa  67  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2016  hypothetical protein  38.16 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5145  hypothetical protein  34.48 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0508  hypothetical protein  34.83 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5307  hypothetical protein  43.48 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.699628 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3755  hypothetical protein  35.96 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0821267  normal  0.731479 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1365  MerR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1244  MerR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000592234  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7803  hypothetical protein  48.89 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.156594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2993  hypothetical protein  39.68 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0973  hypothetical protein  27.59 
 
 		 105 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50788 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1436  transcriptional regulator, MerR family  29.07 
 
 		 140 aa  43.5  0.0009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1862  putative heat shock protein HspR  30.23 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000982592  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1066  cation-efflux system membrane protein  34.67 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000356416  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0975  putative heat shock protein HspR  29.17 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.933748  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0801  transcriptional regulator, MerR family  31.87 
 
 		 164 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.851922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0975  MerR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0330797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>