12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5307 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5307  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  223  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.699628 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3909  hypothetical protein  42.22 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3755  hypothetical protein  41.86 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0821267  normal  0.731479 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6185  hypothetical protein  43.48 
 
 		 107 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.426902 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6364  hypothetical protein  43.48 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.278619  normal  0.148278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2016  hypothetical protein  42.03 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1263  hypothetical protein  36.78 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0636838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5145  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2993  hypothetical protein  41.18 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0426  hypothetical protein  32.97 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0973  hypothetical protein  39.47 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7803  hypothetical protein  56.25 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.156594  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>