22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6185 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6185  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  210  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.426902 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6364  hypothetical protein  80.37 
 
 		 107 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.278619  normal  0.148278 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3909  hypothetical protein  42.17 
 
 		 94 aa  77  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1263  hypothetical protein  35.37 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0636838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0426  hypothetical protein  32.98 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5307  hypothetical protein  43.48 
 
 		 112 aa  60.1  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.699628 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2016  hypothetical protein  32.97 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5145  hypothetical protein  32.18 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0508  hypothetical protein  32.95 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3755  hypothetical protein  34.83 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0821267  normal  0.731479 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7803  hypothetical protein  46.67 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.156594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0973  hypothetical protein  26.44 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50788 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1365  MerR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 124 aa  48.1  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1244  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000592234  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2993  hypothetical protein  34.92 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0975  MerR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1862  putative heat shock protein HspR  29.76 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000982592  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1066  cation-efflux system membrane protein  33.78 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000356416  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0975  putative heat shock protein HspR  31.58 
 
 		 125 aa  42  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.933748  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1436  transcriptional regulator, MerR family  29.73 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0980  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 243 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>