20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0426 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0426  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  229  8.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2016  hypothetical protein  51.58 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5145  hypothetical protein  52.43 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0508  hypothetical protein  42.7 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0973  hypothetical protein  46.07 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50788 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6364  hypothetical protein  34.04 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.278619  normal  0.148278 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3909  hypothetical protein  40.7 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2993  hypothetical protein  43.14 
 
 		 116 aa  62  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1263  hypothetical protein  38.71 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0636838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6185  hypothetical protein  32.98 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.426902 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5307  hypothetical protein  32.97 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.699628 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7803  hypothetical protein  40.82 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.156594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3755  hypothetical protein  32.43 
 
 		 93 aa  47  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0821267  normal  0.731479 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0975  MerR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1244  MerR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000592234  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0555  MerR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1365  MerR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 124 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0024  transcriptional regulator, MerR family  27 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2405  hypothetical protein  39.29 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>