12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0508 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0508  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  225  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5145  hypothetical protein  39.6 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2016  hypothetical protein  44.9 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0426  hypothetical protein  42.7 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6364  hypothetical protein  34.83 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.278619  normal  0.148278 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2993  hypothetical protein  41.25 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6185  hypothetical protein  32.95 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.426902 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0973  hypothetical protein  31.37 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1263  hypothetical protein  34.07 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0636838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3755  hypothetical protein  32.05 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0821267  normal  0.731479 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3909  hypothetical protein  31.34 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7803  hypothetical protein  36.84 
 
 		 65 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.156594  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>