16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5145 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5145  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  219  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2016  hypothetical protein  46.67 
 
 		 112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0426  hypothetical protein  52.43 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0508  hypothetical protein  39.6 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0973  hypothetical protein  31.63 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1263  hypothetical protein  39.13 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0636838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6364  hypothetical protein  34.48 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.278619  normal  0.148278 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2993  hypothetical protein  45.31 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6185  hypothetical protein  32.18 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.426902 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3909  hypothetical protein  35.53 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5307  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.699628 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3755  hypothetical protein  37.14 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0821267  normal  0.731479 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1244  MerR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000592234  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7803  hypothetical protein  40.43 
 
 		 65 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.156594  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1365  MerR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>