More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0741 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0741  ribosomal protein S11  100 
 
 		 134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  83.74 
 
 		 139 aa  201  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  77.59 
 
 		 137 aa  199  8e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4001  30S ribosomal protein S11  81.3 
 
 		 138 aa  198  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000341479  hitchhiker  0.000619325 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2999  30S ribosomal protein S11  82.93 
 
 		 137 aa  194  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737948 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  65.38 
 
 		 131 aa  185  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  68.6 
 
 		 131 aa  185  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  70.9 
 
 		 134 aa  184  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  73.91 
 
 		 131 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  67.16 
 
 		 129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  67.16 
 
 		 129 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  65.67 
 
 		 129 aa  180  5.0000000000000004e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  72.17 
 
 		 131 aa  180  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  68.29 
 
 		 129 aa  180  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  62.31 
 
 		 131 aa  180  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  70.15 
 
 		 134 aa  180  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  64.23 
 
 		 129 aa  180  6e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  65.67 
 
 		 129 aa  180  7e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  65.32 
 
 		 129 aa  180  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  72.17 
 
 		 130 aa  180  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  71.09 
 
 		 130 aa  179  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  64.18 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  69.92 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  69.92 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1434  30S ribosomal protein S11  73.98 
 
 		 137 aa  179  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  64.18 
 
 		 129 aa  178  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  64.18 
 
 		 129 aa  178  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  66.41 
 
 		 130 aa  179  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  64.18 
 
 		 129 aa  178  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  66.41 
 
 		 130 aa  178  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  64.93 
 
 		 129 aa  178  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  69.11 
 
 		 129 aa  177  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4972  30S ribosomal protein S11  73.17 
 
 		 136 aa  177  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  63.43 
 
 		 129 aa  178  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  64.57 
 
 		 129 aa  177  4e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  68.29 
 
 		 129 aa  177  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3384  30S ribosomal protein S11  74.59 
 
 		 137 aa  177  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  64.57 
 
 		 129 aa  177  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  64.57 
 
 		 129 aa  177  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00961  30S ribosomal protein S11  65.62 
 
 		 130 aa  176  7e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000322377  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3671  30S ribosomal protein S11  73.77 
 
 		 135 aa  176  7e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  64.93 
 
 		 129 aa  176  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13496  30S ribosomal protein S11  72.44 
 
 		 139 aa  176  8e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2344e-17  normal  0.330141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1140  30S ribosomal protein S11  73.17 
 
 		 138 aa  176  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1111  30S ribosomal protein S11  73.17 
 
 		 138 aa  176  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1128  30S ribosomal protein S11  73.17 
 
 		 138 aa  176  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0276  30S ribosomal protein S11  70.77 
 
 		 132 aa  176  9e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  68.7 
 
 		 131 aa  176  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  62.2 
 
 		 129 aa  176  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 		 130 aa  176  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2685  30S ribosomal protein S11  74.19 
 
 		 138 aa  175  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000312441  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4292  ribosomal protein S11  72.36 
 
 		 133 aa  175  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0624  30S ribosomal protein S11  64.23 
 
 		 129 aa  174  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000665656  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 129 aa  174  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  63.41 
 
 		 128 aa  174  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  60.63 
 
 		 129 aa  173  6e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3977  30S ribosomal protein S11  64.57 
 
 		 129 aa  173  7e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300038  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0428  30S ribosomal protein S11  64.57 
 
 		 129 aa  173  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.684596  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3799  30S ribosomal protein S11  64.57 
 
 		 129 aa  173  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3685  30S ribosomal protein S11  64.57 
 
 		 129 aa  173  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00109954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3612  30S ribosomal protein S11  64.57 
 
 		 129 aa  173  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000648166  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3720  30S ribosomal protein S11  64.57 
 
 		 129 aa  173  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0247296  normal  0.144698 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3613  30S ribosomal protein S11  64.57 
 
 		 129 aa  173  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00134375  normal  0.497735 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  62.7 
 
 		 130 aa  173  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3783  30S ribosomal protein S11  64.57 
 
 		 129 aa  173  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0247375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3728  30S ribosomal protein S11  63.78 
 
 		 129 aa  173  8e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00156058  hitchhiker  0.00442603 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0236  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 		 130 aa  173  8e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000127993  unclonable  0.00000919144 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1732  30S ribosomal protein S11  70 
 
 		 132 aa  173  9e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  61.9 
 
 		 130 aa  173  9e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03148  30S ribosomal protein S11  64.57 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.175069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0416  ribosomal protein S11  64.57 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000707305  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03099  hypothetical protein  64.57 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.130382  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3592  30S ribosomal protein S11  64.57 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00516698  normal  0.0514386 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4619  30S ribosomal protein S11  64.57 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  73.17 
 
 		 128 aa  172  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0416  30S ribosomal protein S11  64.57 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00339967  unclonable  0.0000000142813 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  65.85 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0181  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 		 130 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000807145  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  67.69 
 
 		 130 aa  172  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3491  30S ribosomal protein S11  64.57 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000857326  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3683  30S ribosomal protein S11  64.57 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000095493  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3877  30S ribosomal protein S11  69.11 
 
 		 135 aa  172  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3780  30S ribosomal protein S11  64.57 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000705759  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001719  SSU ribosomal protein S11p (S14e)  65.04 
 
 		 129 aa  171  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000259501  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00752  30S ribosomal protein S11  65.04 
 
 		 129 aa  171  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3897  30S ribosomal protein S11  71.43 
 
 		 135 aa  171  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4288  30S ribosomal protein S11  72.22 
 
 		 135 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000331944 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2151  30S ribosomal protein S11  65.04 
 
 		 129 aa  171  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000057735  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0193  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 130 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310597  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4481  30S ribosomal protein S11  73.55 
 
 		 135 aa  171  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.401787  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0207  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 130 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000194302  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  56.72 
 
 		 134 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0860  30S ribosomal protein S11  63.71 
 
 		 129 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  56.72 
 
 		 134 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0306  30S ribosomal protein S11  63.78 
 
 		 129 aa  171  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000963543  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0171  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 130 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000137898  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06480  30S ribosomal protein S11  63.71 
 
 		 129 aa  171  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09090  30S ribosomal protein S11  63.71 
 
 		 129 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  56.72 
 
 		 134 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>