66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1964 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1964  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  593  1e-169  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.386343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2366  hypothetical protein  60.98 
 
 		 307 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00393064  normal  0.965104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2319  hypothetical protein  60.98 
 
 		 307 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.902875  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2358  hypothetical protein  61.26 
 
 		 308 aa  332  4e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2627  hypothetical protein  55.67 
 
 		 309 aa  287  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3772  hypothetical protein  59.4 
 
 		 309 aa  264  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.178601 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1813  hypothetical protein  43.41 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1136  membrane protein-like protein  46.18 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.632999 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2882  hypothetical protein  49.32 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.888795  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5385  hypothetical protein  46.36 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0618  hypothetical protein  43.77 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1190  hypothetical protein  39.67 
 
 		 324 aa  155  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.779623  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0875  hypothetical protein  35.4 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.623146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0621  hypothetical protein  30.99 
 
 		 427 aa  86.7  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.231348  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0647  hypothetical protein  29.43 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3066  hypothetical protein  32.08 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.041816  normal  0.269214 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2462  hypothetical protein  25.72 
 
 		 438 aa  67  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2300  hypothetical protein  31.92 
 
 		 424 aa  65.9  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461087 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1399  hypothetical protein  27.44 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.465928  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3806  hypothetical protein  28.06 
 
 		 450 aa  62.4  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1157  hypothetical protein  29.32 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258093  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1240  hypothetical protein  28.38 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2096  hypothetical protein  28.41 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3466  hypothetical protein  27.21 
 
 		 449 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3559  hypothetical protein  29.05 
 
 		 430 aa  59.3  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0087  hypothetical protein  26.49 
 
 		 442 aa  59.3  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.102505  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3348  hypothetical protein  28.69 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0576037  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1736  hypothetical protein  29.26 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1573  hypothetical protein  31.37 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0180  hypothetical protein  28 
 
 		 456 aa  55.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1362  hypothetical protein  29.45 
 
 		 442 aa  53.9  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.338301  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1404  hypothetical protein  28.04 
 
 		 436 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.504832  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2841  hypothetical protein  25.93 
 
 		 337 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3255  hypothetical protein  25.46 
 
 		 337 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3131  hypothetical protein  31.15 
 
 		 520 aa  52.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1438  hypothetical protein  23.86 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1409  hypothetical protein  23.86 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2438  hypothetical protein  27.88 
 
 		 431 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04101  hypothetical protein  26.6 
 
 		 395 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1637  hypothetical protein  28.14 
 
 		 376 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176047 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0014  hypothetical protein  30.05 
 
 		 627 aa  48.5  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000906355  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0149  hypothetical protein  26.55 
 
 		 531 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.739878  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1287  hypothetical protein  24.36 
 
 		 332 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2955  hypothetical protein  27.8 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1382  hypothetical protein  21.83 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17576  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4664  hypothetical protein  25.14 
 
 		 440 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000775683 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0192  hypothetical protein  19.91 
 
 		 335 aa  45.8  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0298  hypothetical protein  32.47 
 
 		 341 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288851 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0631  hypothetical protein  19.91 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.49684 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1741  hypothetical protein  30.77 
 
 		 326 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.698203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0696  hypothetical protein  21.79 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.884285  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3257  hypothetical protein  27.04 
 
 		 539 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.984135  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0523  hypothetical protein  30.23 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.698891 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02040  conserved hypothetical protein TIGR00341  28.26 
 
 		 405 aa  43.9  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.215693  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1618  hypothetical protein  24.46 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29666  predicted protein  25.79 
 
 		 408 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2346  hypothetical protein  30.36 
 
 		 527 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0206723  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2943  hypothetical protein  24.19 
 
 		 465 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_002950  PG0490  hypothetical protein  25 
 
 		 446 aa  43.9  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05070  conserved hypothetical protein TIGR00341  31.49 
 
 		 436 aa  43.1  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.710534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2713  hypothetical protein  26.46 
 
 		 344 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3511  hypothetical protein  26.13 
 
 		 338 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184743  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1610  hypothetical protein  26.83 
 
 		 546 aa  42.7  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000006851 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0527  hypothetical protein  24.11 
 
 		 438 aa  42.7  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0892  hypothetical protein  24.87 
 
 		 429 aa  42.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000427125 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1642  hypothetical protein  40.38 
 
 		 356 aa  42.4  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.592857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>