70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2882 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2882  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  630  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.888795  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1813  hypothetical protein  48.01 
 
 
312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2358  hypothetical protein  47.19 
 
 
308 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2366  hypothetical protein  47.19 
 
 
307 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00393064  normal  0.965104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2319  hypothetical protein  47.19 
 
 
307 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.902875  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2627  hypothetical protein  49.29 
 
 
309 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1964  hypothetical protein  49.3 
 
 
310 aa  230  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.386343  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3772  hypothetical protein  48.6 
 
 
309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.178601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1136  membrane protein-like protein  44.01 
 
 
315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.632999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5385  hypothetical protein  41.14 
 
 
323 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0618  hypothetical protein  43.12 
 
 
274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1190  hypothetical protein  41.78 
 
 
324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.779623  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0875  hypothetical protein  40.53 
 
 
301 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.623146  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0647  hypothetical protein  28.29 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1157  hypothetical protein  30.83 
 
 
429 aa  79.7  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258093  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0621  hypothetical protein  29.84 
 
 
427 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.231348  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0180  hypothetical protein  29 
 
 
456 aa  76.6  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3255  hypothetical protein  31.22 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2841  hypothetical protein  31.22 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1240  hypothetical protein  32.34 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3466  hypothetical protein  27.84 
 
 
449 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2300  hypothetical protein  28.79 
 
 
424 aa  68.9  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.461087 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3131  hypothetical protein  27.18 
 
 
520 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3257  hypothetical protein  30.85 
 
 
539 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.984135  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1736  hypothetical protein  32.85 
 
 
336 aa  64.7  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2096  hypothetical protein  29.59 
 
 
438 aa  63.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0087  hypothetical protein  28.47 
 
 
442 aa  60.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.102505  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02040  conserved hypothetical protein TIGR00341  23.51 
 
 
405 aa  60.1  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.215693  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1637  hypothetical protein  29.08 
 
 
376 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176047 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3348  hypothetical protein  25.35 
 
 
502 aa  60.1  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0576037  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2462  hypothetical protein  26.15 
 
 
438 aa  59.7  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3066  hypothetical protein  28.9 
 
 
430 aa  59.7  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.041816  normal  0.269214 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0014  hypothetical protein  27.36 
 
 
627 aa  58.5  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000906355  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2040  hypothetical protein  29.95 
 
 
331 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.249953 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1399  hypothetical protein  25 
 
 
435 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.465928  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0696  hypothetical protein  27.91 
 
 
348 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.884285  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2206  hypothetical protein  27.31 
 
 
371 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2955  hypothetical protein  25.99 
 
 
354 aa  57.4  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29666  predicted protein  27.51 
 
 
408 aa  57  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1382  hypothetical protein  25.82 
 
 
334 aa  54.7  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17576  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1266  hypothetical protein  28.23 
 
 
292 aa  54.3  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0298  hypothetical protein  32.42 
 
 
341 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288851 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3511  hypothetical protein  27.55 
 
 
338 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184743  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3806  hypothetical protein  30.17 
 
 
450 aa  53.1  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1362  hypothetical protein  26.02 
 
 
442 aa  52.8  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.338301  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1642  hypothetical protein  34.12 
 
 
356 aa  52.8  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.592857 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05070  conserved hypothetical protein TIGR00341  34.41 
 
 
436 aa  52.8  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.710534  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1275  hypothetical protein  30 
 
 
387 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.624785 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04101  hypothetical protein  28.65 
 
 
395 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1618  hypothetical protein  28.08 
 
 
351 aa  51.2  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1404  hypothetical protein  25.38 
 
 
436 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.504832  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4664  hypothetical protein  26.04 
 
 
440 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000775683 
 
 
-
 
NC_002950  PG0490  hypothetical protein  25 
 
 
446 aa  50.4  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1287  hypothetical protein  25.11 
 
 
332 aa  50.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1409  hypothetical protein  24.87 
 
 
331 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1438  hypothetical protein  24.87 
 
 
331 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1573  hypothetical protein  27.36 
 
 
430 aa  49.3  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3559  hypothetical protein  27.05 
 
 
430 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1158  hypothetical protein  30.11 
 
 
335 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.826231  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1092  hypothetical protein  29.9 
 
 
335 aa  47  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2346  hypothetical protein  28.95 
 
 
527 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0206723  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0527  hypothetical protein  23.2 
 
 
438 aa  46.6  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1092  hypothetical protein  30.11 
 
 
335 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0892  hypothetical protein  25.08 
 
 
429 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000427125 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2005  hypothetical protein  26.94 
 
 
352 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.881933 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13461  hypothetical protein  27.04 
 
 
368 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1741  hypothetical protein  26.14 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.698203  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0631  hypothetical protein  23.85 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.49684 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2943  hypothetical protein  25.68 
 
 
465 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0192  hypothetical protein  23.72 
 
 
335 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>