106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1808 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1808  NnrS family protein  100 
 
 
434 aa  820    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193924  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2680  NnrS family protein  44.92 
 
 
406 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1555  NnrS family protein  27.4 
 
 
410 aa  145  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000108211  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1349  NnrS  27.55 
 
 
416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000146845  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0102  hypothetical protein  29.56 
 
 
418 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.139814  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0557  NnrS  28.81 
 
 
402 aa  95.5  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.042435  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6279  NnrS family protein  30.71 
 
 
403 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  0.20499 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0259  hypothetical protein  29.23 
 
 
413 aa  93.6  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2105  NnrS family protein  31.41 
 
 
392 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0196977  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0283  hypothetical protein  29.23 
 
 
413 aa  92.8  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2805  hypothetical protein  29.38 
 
 
390 aa  92.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0494  NnrS family protein  31.19 
 
 
426 aa  92.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.506659  normal  0.505655 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2901  NnrS family protein  29.44 
 
 
414 aa  92.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5672  NnrS family protein  32.71 
 
 
392 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0227  NnrS family protein  33.75 
 
 
390 aa  89  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1450  NnrS family protein  31.68 
 
 
425 aa  89.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.9412  normal  0.157147 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0720  putative heme-Cu membrane protein (NnrS)  26.35 
 
 
393 aa  88.2  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6821  putative membrane protein, NnrS-like protein  29.18 
 
 
403 aa  87  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1665  NnrS family protein  27.25 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410131  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2677  NnrS family protein  27.25 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0244063 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002671  NnrS protein  28.64 
 
 
394 aa  82  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0630  Heme/copper membrane protein of NnrS family protein  26.88 
 
 
394 aa  80.5  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2849  NnrS family protein  29.56 
 
 
393 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2574  NnrS family protein  35.03 
 
 
392 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00111099  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1673  NnrS family protein  27.36 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496066  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2876  NnrS family protein  44.32 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534905  hitchhiker  0.00000000207371 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0648  NnrS  27.88 
 
 
393 aa  74.7  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86713  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2940  NnrS family protein  29.01 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0686  NnrS family protein  24.77 
 
 
431 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1235  NnrS  27.89 
 
 
403 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00575591  unclonable  0.0000000301222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3791  NnrS  27.61 
 
 
409 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.527545  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2560  NnrS family protein  29.11 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12013  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4037  NnrS  27.46 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4230  NnrS family protein  29.53 
 
 
404 aa  70.5  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4044  NnrS family protein  41.18 
 
 
504 aa  70.1  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2322  NnrS family protein  26.54 
 
 
390 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000140024  normal  0.965133 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4275  NnrS  30.23 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1006  NnrS family protein  30.28 
 
 
389 aa  67  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0347076  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1910  hypothetical protein  42.71 
 
 
414 aa  67  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1680  NnrS family protein  54.55 
 
 
390 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1702  NnrS family protein  56.72 
 
 
390 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.591488  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4727  NnrS  29.15 
 
 
398 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3473  NnrS  25.99 
 
 
422 aa  65.1  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03317  hypothetical protein  36.36 
 
 
406 aa  65.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3182  NnrS family protein  41.35 
 
 
396 aa  65.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1524  NnrS family protein  28.54 
 
 
394 aa  65.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2303  hypothetical protein  30.86 
 
 
432 aa  64.3  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2587  NnrS family protein  50.72 
 
 
390 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16699  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1409  hypothetical protein  42.55 
 
 
424 aa  63.5  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.922088  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0504  NnrS family protein  27.23 
 
 
403 aa  63.5  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2874  NnrS  25.17 
 
 
386 aa  62.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5307  putative heme/copper membrane protein  26.95 
 
 
401 aa  60.1  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0853882  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1348  hypothetical protein  22.79 
 
 
417 aa  59.7  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03874  Heme/copper membrane protein  43.68 
 
 
400 aa  58.9  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4999  NnrS  40.38 
 
 
405 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.441301  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3970  NnrS family protein  27.73 
 
 
398 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2168  NnrS  29.46 
 
 
384 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2607  NnrS family protein  29.26 
 
 
395 aa  57.4  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4166  NnrS family protein  32 
 
 
389 aa  56.6  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0849  putative ATP synthase F0, A subunit  36.36 
 
 
428 aa  56.6  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1810  hypothetical protein  30.85 
 
 
407 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1884  NnrS  31.91 
 
 
401 aa  55.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0526931  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0765  NnrS family protein  21.83 
 
 
409 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.960663  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3037  NnrS family protein  25.28 
 
 
403 aa  55.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.226927  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0307  NnrS family protein  27.76 
 
 
390 aa  54.7  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.799454  normal  0.0277833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2840  NnrS family protein  29.56 
 
 
393 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250907  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4283  hypothetical protein  45.45 
 
 
401 aa  54.3  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1288  hypothetical protein  46.58 
 
 
389 aa  54.3  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0467877  normal  0.017488 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1515  NnrS family protein  41.3 
 
 
409 aa  54.7  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329363  normal  0.0719715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2847  NnrS family protein  50 
 
 
401 aa  53.5  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2336  NnrS family protein  50 
 
 
401 aa  53.5  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00114269  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1119  NnrS  50.72 
 
 
396 aa  52.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3603  NnrS family protein  42.11 
 
 
403 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.147714  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1465  NnrS family protein  39.78 
 
 
409 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185105  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2741  hypothetical protein  43.42 
 
 
442 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.300362  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0630  hypothetical protein  43.42 
 
 
407 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446034  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2807  Heme/copper membrane protein  43.42 
 
 
407 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.817552  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2830  hypothetical protein  36.96 
 
 
409 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2159  NnrS family protein  41.43 
 
 
398 aa  51.2  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0400909  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2382  hypothetical protein  43.42 
 
 
407 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.863987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2905  hypothetical protein  43.42 
 
 
407 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2683  hypothetical protein  43.42 
 
 
407 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0928  NnrS family protein  37.37 
 
 
397 aa  50.4  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0391816  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2181  NnrS  37.78 
 
 
385 aa  50.4  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2362  NnrS family protein  43.42 
 
 
403 aa  50.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000703097  decreased coverage  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0614  hypothetical protein  27.78 
 
 
406 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4289  NnrS  27.43 
 
 
388 aa  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2398  hypothetical protein  27.21 
 
 
398 aa  50.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2891  hypothetical protein  27.21 
 
 
398 aa  50.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00927369  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1711  hypothetical protein  27.21 
 
 
398 aa  50.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129457  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3145  NnrS family protein  31.79 
 
 
394 aa  50.1  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0163982  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29660  hypothetical protein  47.89 
 
 
397 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1410  NnrS-like protein  28.24 
 
 
399 aa  49.7  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2837  NnrS  42.86 
 
 
403 aa  49.7  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0722604  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2537  hypothetical protein  49.28 
 
 
388 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1475  NnrS family protein  38.78 
 
 
399 aa  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0760953 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1227  NnrS family protein  42.67 
 
 
403 aa  47.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25611  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0687  NnrS family protein  43.42 
 
 
403 aa  47.4  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3582  NnrS family protein  39.39 
 
 
391 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.936992  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2701  heme/copper membrane protein  39.74 
 
 
398 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>