114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2830 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2830  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  763    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1465  NnrS family protein  98.29 
 
 		 409 aa  752    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185105  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1515  NnrS family protein  85.33 
 
 		 409 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329363  normal  0.0719715 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2901  NnrS family protein  32.36 
 
 		 414 aa  153  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0259  hypothetical protein  31.38 
 
 		 413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0557  NnrS  33.67 
 
 		 402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.042435  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0283  hypothetical protein  31.38 
 
 		 413 aa  146  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6279  NnrS family protein  35.17 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  0.20499 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4044  NnrS family protein  39.04 
 
 		 504 aa  145  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2105  NnrS family protein  34.88 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0196977  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0648  NnrS  34.97 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86713  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0630  Heme/copper membrane protein of NnrS family protein  27.94 
 
 		 394 aa  124  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1006  NnrS family protein  36.83 
 
 		 389 aa  123  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0347076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2607  NnrS family protein  31.93 
 
 		 395 aa  123  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3473  NnrS  30.67 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0307  NnrS family protein  31.32 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.799454  normal  0.0277833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5672  NnrS family protein  33.95 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2876  NnrS family protein  27.89 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534905  hitchhiker  0.00000000207371 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3859  NnrS family protein  32.65 
 
 		 391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2849  NnrS family protein  32.82 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2805  hypothetical protein  29.86 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3182  NnrS family protein  33.42 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0227  NnrS family protein  33.77 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4283  hypothetical protein  30.1 
 
 		 401 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1673  NnrS family protein  29.77 
 
 		 408 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496066  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1798  hypothetical protein  31.39 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.425687  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0686  NnrS family protein  30.57 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03874  Heme/copper membrane protein  27.63 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0614  hypothetical protein  30.25 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2398  hypothetical protein  30.25 
 
 		 398 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2891  hypothetical protein  30.25 
 
 		 398 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00927369  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1711  hypothetical protein  30.25 
 
 		 398 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129457  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1910  hypothetical protein  31.09 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4037  NnrS  31.4 
 
 		 408 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0967  NnrS family protein  32.28 
 
 		 397 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2677  NnrS family protein  29.06 
 
 		 390 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0244063 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3037  NnrS family protein  31.31 
 
 		 403 aa  98.6  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.226927  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1680  NnrS family protein  29.06 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2840  NnrS family protein  33.5 
 
 		 393 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3970  NnrS family protein  29.18 
 
 		 398 aa  97.4  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2322  NnrS family protein  29.02 
 
 		 390 aa  97.4  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000140024  normal  0.965133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6821  putative membrane protein, NnrS-like protein  31.36 
 
 		 403 aa  97.4  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0849  putative ATP synthase F0, A subunit  27.59 
 
 		 428 aa  97.1  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0102  hypothetical protein  29.32 
 
 		 418 aa  96.3  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.139814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2759  hypothetical protein  30.5 
 
 		 398 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1665  NnrS family protein  27.85 
 
 		 390 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410131  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2168  NnrS  31.84 
 
 		 384 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1410  NnrS-like protein  30.34 
 
 		 399 aa  94.4  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03317  hypothetical protein  28.94 
 
 		 406 aa  94.4  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2303  hypothetical protein  31.46 
 
 		 432 aa  94.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0720  putative heme-Cu membrane protein (NnrS)  28.18 
 
 		 393 aa  94  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2701  heme/copper membrane protein  30.25 
 
 		 398 aa  93.6  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1973  NnrS family protein  33.53 
 
 		 397 aa  93.2  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2821  Heme/copper membrane protein  30.25 
 
 		 398 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2336  NnrS family protein  31.29 
 
 		 401 aa  92  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00114269  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3145  NnrS family protein  29.95 
 
 		 394 aa  92  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0163982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2847  NnrS family protein  31.29 
 
 		 401 aa  92  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1119  NnrS  40.4 
 
 		 396 aa  92  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002671  NnrS protein  29.3 
 
 		 394 aa  91.3  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1409  hypothetical protein  33.16 
 
 		 424 aa  90.5  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.922088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3791  NnrS  29.12 
 
 		 409 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.527545  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2940  NnrS family protein  31.07 
 
 		 393 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1235  NnrS  30.86 
 
 		 403 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00575591  unclonable  0.0000000301222 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2587  NnrS family protein  29.02 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16699  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0504  NnrS family protein  29.45 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4727  NnrS  31.36 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1702  NnrS family protein  26.98 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.591488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1524  NnrS family protein  31.4 
 
 		 394 aa  86.3  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1884  NnrS  33.63 
 
 		 401 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0526931  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4275  NnrS  30.96 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0687  NnrS family protein  30.16 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3582  NnrS family protein  33.23 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.936992  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4230  NnrS family protein  33.33 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2560  NnrS family protein  29.49 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12013  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0328  hypothetical protein  33.43 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5307  putative heme/copper membrane protein  29.97 
 
 		 401 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0853882  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2574  NnrS family protein  34.58 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00111099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2425  NnrS family protein  28.74 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.194019  normal  0.204544 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2495  NnrS family protein  28.74 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4999  NnrS  29.89 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.441301  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2322  NnrS family protein  29.19 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138032  normal  0.897473 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2181  NnrS  29.62 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1810  hypothetical protein  28.81 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3603  NnrS family protein  28.41 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.147714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29660  hypothetical protein  32.28 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1288  hypothetical protein  27.33 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0467877  normal  0.017488 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1227  NnrS family protein  26.22 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25611  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2837  NnrS  26.71 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0722604  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4289  NnrS  27.46 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0630  hypothetical protein  28.08 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446034  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2807  Heme/copper membrane protein  28.08 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.817552  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2382  hypothetical protein  28.08 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.863987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2905  hypothetical protein  28.08 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2537  hypothetical protein  31.74 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2683  hypothetical protein  28.08 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2741  hypothetical protein  28.36 
 
 		 442 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.300362  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2362  NnrS family protein  26.65 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000703097  decreased coverage  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0918  NnrS  36.75 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.948629  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1348  hypothetical protein  24.4 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3399  hypothetical protein  31.23 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>