114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0918 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0918  NnrS  100 
 
 		 229 aa  449  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.948629  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0307  NnrS family protein  44.37 
 
 		 390 aa  119  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.799454  normal  0.0277833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0648  NnrS  54.41 
 
 		 393 aa  115  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86713  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0259  hypothetical protein  45.78 
 
 		 413 aa  115  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0283  hypothetical protein  45.78 
 
 		 413 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3859  NnrS family protein  56.13 
 
 		 391 aa  113  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0557  NnrS  50 
 
 		 402 aa  108  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.042435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2901  NnrS family protein  42.5 
 
 		 414 aa  108  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4275  NnrS  46.32 
 
 		 401 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1524  NnrS family protein  45 
 
 		 394 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4037  NnrS  39.63 
 
 		 408 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0227  NnrS family protein  39.35 
 
 		 390 aa  93.2  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1673  NnrS family protein  43.23 
 
 		 408 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496066  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4283  hypothetical protein  37.89 
 
 		 401 aa  92  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2303  hypothetical protein  41.67 
 
 		 432 aa  91.7  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1798  hypothetical protein  41.61 
 
 		 406 aa  91.3  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.425687  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6279  NnrS family protein  41.18 
 
 		 403 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  0.20499 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0614  hypothetical protein  40.15 
 
 		 406 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2821  Heme/copper membrane protein  40.15 
 
 		 398 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3970  NnrS family protein  39.24 
 
 		 398 aa  88.2  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2398  hypothetical protein  40.15 
 
 		 398 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2891  hypothetical protein  40.15 
 
 		 398 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00927369  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2701  heme/copper membrane protein  40.15 
 
 		 398 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2759  hypothetical protein  40.15 
 
 		 398 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1711  hypothetical protein  40.15 
 
 		 398 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129457  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4727  NnrS  41.3 
 
 		 398 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3791  NnrS  40.13 
 
 		 409 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.527545  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0630  Heme/copper membrane protein of NnrS family protein  32.7 
 
 		 394 aa  86.3  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2805  hypothetical protein  39.58 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2847  NnrS family protein  37.42 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2336  NnrS family protein  37.42 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00114269  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1410  NnrS-like protein  35.53 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03874  Heme/copper membrane protein  39.01 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2587  NnrS family protein  37.75 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16699  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1119  NnrS  44.7 
 
 		 396 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4289  NnrS  30.97 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5672  NnrS family protein  43.07 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3145  NnrS family protein  37.86 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0163982  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4999  NnrS  33.85 
 
 		 405 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.441301  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2876  NnrS family protein  37.06 
 
 		 406 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534905  hitchhiker  0.00000000207371 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1702  NnrS family protein  39.07 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.591488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2560  NnrS family protein  40 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12013  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29660  hypothetical protein  37.66 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1409  hypothetical protein  42.25 
 
 		 424 aa  76.3  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.922088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2425  NnrS family protein  39.74 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.194019  normal  0.204544 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2495  NnrS family protein  39.74 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1665  NnrS family protein  39.46 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410131  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1006  NnrS family protein  40.61 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0347076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2677  NnrS family protein  38.41 
 
 		 390 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0244063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6821  putative membrane protein, NnrS-like protein  37.33 
 
 		 403 aa  75.5  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1680  NnrS family protein  38.78 
 
 		 390 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1235  NnrS  43.48 
 
 		 403 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00575591  unclonable  0.0000000301222 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1884  NnrS  39.35 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0526931  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2105  NnrS family protein  40.31 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0196977  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0102  hypothetical protein  32.89 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.139814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2537  hypothetical protein  38.3 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0720  putative heme-Cu membrane protein (NnrS)  29.15 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3473  NnrS  31.05 
 
 		 422 aa  72  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2322  NnrS family protein  36.91 
 
 		 390 aa  72  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000140024  normal  0.965133 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1515  NnrS family protein  38.41 
 
 		 409 aa  72  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329363  normal  0.0719715 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03317  hypothetical protein  34.86 
 
 		 406 aa  72  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1288  hypothetical protein  42.03 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0467877  normal  0.017488 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2159  NnrS family protein  41.61 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0400909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2607  NnrS family protein  37.84 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3037  NnrS family protein  31.76 
 
 		 403 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.226927  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3136  NnrS family protein  32.45 
 
 		 375 aa  68.2  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4230  NnrS family protein  39.88 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0504  NnrS family protein  35.86 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1810  hypothetical protein  32.45 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5307  putative heme/copper membrane protein  33.58 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0853882  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2807  Heme/copper membrane protein  33.58 
 
 		 407 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.817552  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2683  hypothetical protein  33.58 
 
 		 407 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2741  hypothetical protein  33.58 
 
 		 442 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.300362  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2849  NnrS family protein  40.16 
 
 		 393 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0630  hypothetical protein  33.58 
 
 		 407 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446034  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2382  hypothetical protein  33.58 
 
 		 407 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.863987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2905  hypothetical protein  33.58 
 
 		 407 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2840  NnrS family protein  40.16 
 
 		 393 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1910  hypothetical protein  32.39 
 
 		 414 aa  65.1  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3582  NnrS family protein  42.37 
 
 		 391 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.936992  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3399  hypothetical protein  38.41 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002671  NnrS protein  34.5 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0849  putative ATP synthase F0, A subunit  30.56 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2874  NnrS  28.43 
 
 		 386 aa  62.8  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2362  NnrS family protein  32.03 
 
 		 403 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000703097  decreased coverage  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1475  NnrS family protein  43.62 
 
 		 399 aa  62.4  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0760953 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1227  NnrS family protein  28.66 
 
 		 403 aa  62  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25611  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0765  NnrS family protein  35.42 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.960663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0967  NnrS family protein  37.06 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1485  NnrS-like protein  36.17 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0230809  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2322  NnrS family protein  32 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138032  normal  0.897473 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0442  NnrS family protein  35.43 
 
 		 444 aa  57  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.171135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3603  NnrS family protein  29.71 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.147714  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2181  NnrS  29.93 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2837  NnrS  28.07 
 
 		 403 aa  55.1  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0722604  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0687  NnrS family protein  30.13 
 
 		 403 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0433  NnrS family protein  34.17 
 
 		 444 aa  55.1  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1973  NnrS family protein  38.73 
 
 		 397 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2168  NnrS  31.61 
 
 		 384 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1702  NnrS family protein  37.08 
 
 		 433 aa  51.2  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.82539  normal  0.0719493 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>