123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1702 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2677  NnrS family protein  96.41 
 
 
390 aa  707    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0244063 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1680  NnrS family protein  97.18 
 
 
390 aa  717    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1665  NnrS family protein  96.92 
 
 
390 aa  712    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410131  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1702  NnrS family protein  100 
 
 
390 aa  755    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.591488  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2805  hypothetical protein  71.47 
 
 
390 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2587  NnrS family protein  72.56 
 
 
390 aa  551  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16699  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2425  NnrS family protein  71.54 
 
 
390 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.194019  normal  0.204544 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2495  NnrS family protein  71.54 
 
 
390 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2876  NnrS family protein  57.18 
 
 
406 aa  441  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534905  hitchhiker  0.00000000207371 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2322  NnrS family protein  57.95 
 
 
390 aa  431  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000140024  normal  0.965133 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1288  hypothetical protein  54.48 
 
 
389 aa  360  2e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0467877  normal  0.017488 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03874  Heme/copper membrane protein  44 
 
 
400 aa  278  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0630  Heme/copper membrane protein of NnrS family protein  39.34 
 
 
394 aa  252  8.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3037  NnrS family protein  38.82 
 
 
403 aa  250  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.226927  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0504  NnrS family protein  40.34 
 
 
403 aa  248  9e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1227  NnrS family protein  38.59 
 
 
403 aa  236  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25611  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0687  NnrS family protein  38.08 
 
 
403 aa  235  8e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03317  hypothetical protein  39.31 
 
 
406 aa  230  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2849  NnrS family protein  40 
 
 
393 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4283  hypothetical protein  41.34 
 
 
401 aa  228  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0720  putative heme-Cu membrane protein (NnrS)  38.71 
 
 
393 aa  228  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2837  NnrS  39.31 
 
 
403 aa  222  9e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0722604  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002671  NnrS protein  38.37 
 
 
394 aa  218  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3603  NnrS family protein  37.19 
 
 
403 aa  218  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.147714  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3582  NnrS family protein  42.64 
 
 
391 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.936992  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2362  NnrS family protein  37.96 
 
 
403 aa  215  9e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000703097  decreased coverage  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1409  hypothetical protein  41.41 
 
 
424 aa  213  5.999999999999999e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.922088  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2940  NnrS family protein  41 
 
 
393 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2840  NnrS family protein  40.25 
 
 
393 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250907  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1910  hypothetical protein  37.91 
 
 
414 aa  210  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29660  hypothetical protein  42.71 
 
 
397 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0765  NnrS family protein  33.74 
 
 
409 aa  196  8.000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.960663  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2168  NnrS  40.21 
 
 
384 aa  193  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2537  hypothetical protein  43.22 
 
 
388 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2901  NnrS family protein  36.29 
 
 
414 aa  192  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2560  NnrS family protein  38.1 
 
 
397 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12013  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0283  hypothetical protein  36.6 
 
 
413 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0259  hypothetical protein  36.6 
 
 
413 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3473  NnrS  36.3 
 
 
422 aa  189  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6279  NnrS family protein  36.58 
 
 
403 aa  186  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  0.20499 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0227  NnrS family protein  37.93 
 
 
390 aa  182  6e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0102  hypothetical protein  34.54 
 
 
418 aa  182  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.139814  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3970  NnrS family protein  35.22 
 
 
398 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1410  NnrS-like protein  36.39 
 
 
399 aa  179  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1673  NnrS family protein  35.86 
 
 
408 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496066  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2607  NnrS family protein  36.45 
 
 
395 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2336  NnrS family protein  36.27 
 
 
401 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00114269  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0557  NnrS  35.34 
 
 
402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.042435  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3145  NnrS family protein  35.75 
 
 
394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0163982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2847  NnrS family protein  36.27 
 
 
401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4727  NnrS  36.8 
 
 
398 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0686  NnrS family protein  34.96 
 
 
431 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1348  hypothetical protein  34.58 
 
 
417 aa  172  7.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2303  hypothetical protein  35.08 
 
 
432 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0849  putative ATP synthase F0, A subunit  34.12 
 
 
428 aa  169  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1235  NnrS  34.99 
 
 
403 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00575591  unclonable  0.0000000301222 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2398  hypothetical protein  31.92 
 
 
398 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2891  hypothetical protein  31.92 
 
 
398 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00927369  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1711  hypothetical protein  31.92 
 
 
398 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129457  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0614  hypothetical protein  31.92 
 
 
406 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4230  NnrS family protein  35.42 
 
 
404 aa  160  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0648  NnrS  35.86 
 
 
393 aa  160  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86713  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1884  NnrS  35.06 
 
 
401 aa  159  9e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0526931  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1798  hypothetical protein  32.25 
 
 
406 aa  159  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.425687  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3791  NnrS  34.04 
 
 
409 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.527545  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4999  NnrS  36.92 
 
 
405 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.441301  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0307  NnrS family protein  31.83 
 
 
390 aa  155  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.799454  normal  0.0277833 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2759  hypothetical protein  32.17 
 
 
398 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2701  heme/copper membrane protein  32.17 
 
 
398 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5307  putative heme/copper membrane protein  30.81 
 
 
401 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0853882  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2181  NnrS  32.9 
 
 
385 aa  150  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3182  NnrS family protein  34.26 
 
 
396 aa  150  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1006  NnrS family protein  37.27 
 
 
389 aa  149  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0347076  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2821  Heme/copper membrane protein  31.92 
 
 
398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2105  NnrS family protein  33.8 
 
 
392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0196977  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3859  NnrS family protein  34.43 
 
 
391 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4037  NnrS  33.77 
 
 
408 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5672  NnrS family protein  34.38 
 
 
392 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6821  putative membrane protein, NnrS-like protein  32.08 
 
 
403 aa  146  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1524  NnrS family protein  33.42 
 
 
394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4275  NnrS  33.42 
 
 
401 aa  140  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0967  NnrS family protein  30.38 
 
 
397 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1119  NnrS  37.5 
 
 
396 aa  138  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1475  NnrS family protein  32.76 
 
 
399 aa  138  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0760953 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3399  hypothetical protein  31.87 
 
 
403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2159  NnrS family protein  33.58 
 
 
398 aa  133  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0400909  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1810  hypothetical protein  31.87 
 
 
407 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2574  NnrS family protein  33.16 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00111099  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3288  NnrS family protein  32.67 
 
 
404 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451558  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2741  hypothetical protein  29.21 
 
 
442 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.300362  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2807  Heme/copper membrane protein  29.01 
 
 
407 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.817552  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3610  NnrS family protein  32.67 
 
 
404 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.84805  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0630  hypothetical protein  28.95 
 
 
407 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446034  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2382  hypothetical protein  28.95 
 
 
407 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.863987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2905  hypothetical protein  28.95 
 
 
407 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2683  hypothetical protein  28.95 
 
 
407 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2322  NnrS family protein  32.3 
 
 
400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138032  normal  0.897473 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1973  NnrS family protein  30.77 
 
 
397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0328  hypothetical protein  31.85 
 
 
397 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2874  NnrS  30.41 
 
 
386 aa  102  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>