114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1515 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1515  NnrS family protein  100 
 
 		 409 aa  764    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329363  normal  0.0719715 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2830  hypothetical protein  85.33 
 
 		 409 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1465  NnrS family protein  84.84 
 
 		 409 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185105  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2901  NnrS family protein  31.66 
 
 		 414 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0283  hypothetical protein  31.02 
 
 		 413 aa  159  8e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0259  hypothetical protein  30.75 
 
 		 413 aa  157  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4044  NnrS family protein  38.79 
 
 		 504 aa  153  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2105  NnrS family protein  35.06 
 
 		 392 aa  135  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0196977  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6279  NnrS family protein  33.33 
 
 		 403 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  0.20499 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0648  NnrS  36.44 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86713  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0557  NnrS  32.24 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.042435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0307  NnrS family protein  31.41 
 
 		 390 aa  124  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.799454  normal  0.0277833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5672  NnrS family protein  36.11 
 
 		 392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2607  NnrS family protein  30.79 
 
 		 395 aa  116  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0630  Heme/copper membrane protein of NnrS family protein  27.27 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1006  NnrS family protein  35.6 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0347076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1798  hypothetical protein  31.65 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.425687  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0720  putative heme-Cu membrane protein (NnrS)  29.43 
 
 		 393 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4037  NnrS  29.28 
 
 		 408 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3473  NnrS  30.57 
 
 		 422 aa  110  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2849  NnrS family protein  33.25 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3182  NnrS family protein  32.1 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1673  NnrS family protein  29.74 
 
 		 408 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496066  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2805  hypothetical protein  32.66 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3791  NnrS  30.15 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.527545  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1235  NnrS  32.56 
 
 		 403 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00575591  unclonable  0.0000000301222 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0614  hypothetical protein  29.37 
 
 		 406 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2398  hypothetical protein  29.37 
 
 		 398 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2891  hypothetical protein  29.37 
 
 		 398 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00927369  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1711  hypothetical protein  29.37 
 
 		 398 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129457  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3037  NnrS family protein  31.73 
 
 		 403 aa  106  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.226927  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1910  hypothetical protein  31.45 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0227  NnrS family protein  32.38 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3970  NnrS family protein  30.67 
 
 		 398 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4275  NnrS  33.67 
 
 		 401 aa  103  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2759  hypothetical protein  29.61 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2876  NnrS family protein  27.75 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534905  hitchhiker  0.00000000207371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2840  NnrS family protein  34.01 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0967  NnrS family protein  32.72 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6821  putative membrane protein, NnrS-like protein  32.15 
 
 		 403 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0849  putative ATP synthase F0, A subunit  27.42 
 
 		 428 aa  100  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3859  NnrS family protein  33.53 
 
 		 391 aa  99.8  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3145  NnrS family protein  31.23 
 
 		 394 aa  99.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0163982  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2701  heme/copper membrane protein  29.37 
 
 		 398 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4283  hypothetical protein  28.94 
 
 		 401 aa  98.2  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2821  Heme/copper membrane protein  29.2 
 
 		 398 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1410  NnrS-like protein  31.27 
 
 		 399 aa  99  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03317  hypothetical protein  29.07 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0102  hypothetical protein  30.13 
 
 		 418 aa  97.4  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.139814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002671  NnrS protein  29.78 
 
 		 394 aa  97.4  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2322  NnrS family protein  29.08 
 
 		 390 aa  96.3  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000140024  normal  0.965133 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2303  hypothetical protein  32.24 
 
 		 432 aa  95.9  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2677  NnrS family protein  30.4 
 
 		 390 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0244063 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2574  NnrS family protein  34.3 
 
 		 392 aa  94  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00111099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0686  NnrS family protein  29.06 
 
 		 431 aa  94.4  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1680  NnrS family protein  30.68 
 
 		 390 aa  94  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1973  NnrS family protein  31.67 
 
 		 397 aa  93.2  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1665  NnrS family protein  30.4 
 
 		 390 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410131  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5307  putative heme/copper membrane protein  29.39 
 
 		 401 aa  91.3  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0853882  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4999  NnrS  31.62 
 
 		 405 aa  90.1  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.441301  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03874  Heme/copper membrane protein  27.41 
 
 		 400 aa  90.1  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2181  NnrS  30.2 
 
 		 385 aa  89.7  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2847  NnrS family protein  30.21 
 
 		 401 aa  89.7  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2336  NnrS family protein  30.21 
 
 		 401 aa  89.7  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00114269  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1119  NnrS  35.84 
 
 		 396 aa  88.6  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3582  NnrS family protein  34.16 
 
 		 391 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.936992  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1524  NnrS family protein  31.13 
 
 		 394 aa  87.8  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0504  NnrS family protein  30.52 
 
 		 403 aa  87.8  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2587  NnrS family protein  31.36 
 
 		 390 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16699  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2940  NnrS family protein  31.73 
 
 		 393 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4230  NnrS family protein  33.66 
 
 		 404 aa  86.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0328  hypothetical protein  31.98 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1884  NnrS  33.72 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0526931  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1409  hypothetical protein  30.49 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.922088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4727  NnrS  31.87 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0687  NnrS family protein  28.96 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1810  hypothetical protein  29.03 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2837  NnrS  28.71 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0722604  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3603  NnrS family protein  29.07 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.147714  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1702  NnrS family protein  29.58 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.591488  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0630  hypothetical protein  29.47 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446034  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2807  Heme/copper membrane protein  29.47 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.817552  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2168  NnrS  29.97 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2382  hypothetical protein  29.47 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.863987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2905  hypothetical protein  29.47 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2683  hypothetical protein  29.47 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1227  NnrS family protein  28.43 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25611  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2741  hypothetical protein  29.47 
 
 		 442 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.300362  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1475  NnrS family protein  32.76 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0760953 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2425  NnrS family protein  29.53 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.194019  normal  0.204544 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2495  NnrS family protein  29.53 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2322  NnrS family protein  27.46 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138032  normal  0.897473 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0765  NnrS family protein  25.28 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.960663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0918  NnrS  38.41 
 
 		 229 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.948629  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2560  NnrS family protein  30.37 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12013  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2362  NnrS family protein  25.93 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000703097  decreased coverage  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0928  NnrS family protein  28.57 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0391816  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1485  NnrS-like protein  29.11 
 
 		 356 aa  57  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0230809  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4289  NnrS  24.48 
 
 		 388 aa  57  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2874  NnrS  37.86 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>