120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6279 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6279  NnrS family protein  100 
 
 		 403 aa  781    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  0.20499 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0283  hypothetical protein  58.23 
 
 		 413 aa  457  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0259  hypothetical protein  57.97 
 
 		 413 aa  455  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2901  NnrS family protein  57.47 
 
 		 414 aa  450  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2105  NnrS family protein  48.91 
 
 		 392 aa  291  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0196977  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1673  NnrS family protein  42.39 
 
 		 408 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496066  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6821  putative membrane protein, NnrS-like protein  43.05 
 
 		 403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1235  NnrS  43.73 
 
 		 403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00575591  unclonable  0.0000000301222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5672  NnrS family protein  48.32 
 
 		 392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0967  NnrS family protein  44.74 
 
 		 397 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2303  hypothetical protein  46.53 
 
 		 432 aa  266  4e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4275  NnrS  47.01 
 
 		 401 aa  256  5e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4037  NnrS  43.11 
 
 		 408 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1524  NnrS family protein  44.96 
 
 		 394 aa  253  6e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3791  NnrS  42.53 
 
 		 409 aa  253  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.527545  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1006  NnrS family protein  46.91 
 
 		 389 aa  252  8.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0347076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0557  NnrS  41.69 
 
 		 402 aa  248  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.042435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3859  NnrS family protein  44.39 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4230  NnrS family protein  43.9 
 
 		 404 aa  240  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2574  NnrS family protein  50.62 
 
 		 392 aa  237  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00111099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0648  NnrS  43.12 
 
 		 393 aa  233  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86713  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1973  NnrS family protein  44.74 
 
 		 397 aa  223  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0328  hypothetical protein  44.74 
 
 		 397 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0307  NnrS family protein  38.87 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.799454  normal  0.0277833 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2876  NnrS family protein  35.36 
 
 		 406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534905  hitchhiker  0.00000000207371 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2322  NnrS family protein  35.77 
 
 		 390 aa  197  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000140024  normal  0.965133 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0102  hypothetical protein  36.78 
 
 		 418 aa  196  9e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.139814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1680  NnrS family protein  36.48 
 
 		 390 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1119  NnrS  42.39 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2805  hypothetical protein  35.43 
 
 		 390 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1665  NnrS family protein  36.72 
 
 		 390 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410131  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2587  NnrS family protein  36.39 
 
 		 390 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16699  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2677  NnrS family protein  36.46 
 
 		 390 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0244063 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03874  Heme/copper membrane protein  34.82 
 
 		 400 aa  186  9e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1702  NnrS family protein  36.58 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.591488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1409  hypothetical protein  40.41 
 
 		 424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.922088  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4283  hypothetical protein  35.71 
 
 		 401 aa  174  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2336  NnrS family protein  35.25 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00114269  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2847  NnrS family protein  35.25 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2849  NnrS family protein  37.15 
 
 		 393 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1798  hypothetical protein  38.08 
 
 		 406 aa  170  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.425687  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1410  NnrS-like protein  33.25 
 
 		 399 aa  169  9e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0614  hypothetical protein  37.15 
 
 		 406 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4289  NnrS  33.85 
 
 		 388 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2398  hypothetical protein  37.15 
 
 		 398 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2891  hypothetical protein  37.15 
 
 		 398 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00927369  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1711  hypothetical protein  37.15 
 
 		 398 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129457  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0630  Heme/copper membrane protein of NnrS family protein  29.22 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2425  NnrS family protein  37.27 
 
 		 390 aa  159  7e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.194019  normal  0.204544 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2495  NnrS family protein  37.27 
 
 		 390 aa  159  7e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3473  NnrS  33.25 
 
 		 422 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3970  NnrS family protein  35.07 
 
 		 398 aa  159  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3182  NnrS family protein  35.92 
 
 		 396 aa  159  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2607  NnrS family protein  35.26 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03317  hypothetical protein  31.07 
 
 		 406 aa  155  9e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2940  NnrS family protein  35.48 
 
 		 393 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2759  hypothetical protein  37.4 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2701  heme/copper membrane protein  37.4 
 
 		 398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2821  Heme/copper membrane protein  37.4 
 
 		 398 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0504  NnrS family protein  31.98 
 
 		 403 aa  153  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4727  NnrS  37.08 
 
 		 398 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3037  NnrS family protein  30.33 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.226927  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0687  NnrS family protein  30.1 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2362  NnrS family protein  31.57 
 
 		 403 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000703097  decreased coverage  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0765  NnrS family protein  29.01 
 
 		 409 aa  150  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.960663  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2840  NnrS family protein  37.15 
 
 		 393 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1288  hypothetical protein  34.03 
 
 		 389 aa  149  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0467877  normal  0.017488 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5307  putative heme/copper membrane protein  34.75 
 
 		 401 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0853882  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3603  NnrS family protein  32.25 
 
 		 403 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.147714  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0720  putative heme-Cu membrane protein (NnrS)  27.99 
 
 		 393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1515  NnrS family protein  32.19 
 
 		 409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329363  normal  0.0719715 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3582  NnrS family protein  39.12 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.936992  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2168  NnrS  34.38 
 
 		 384 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1227  NnrS family protein  29.87 
 
 		 403 aa  147  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25611  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1910  hypothetical protein  30.37 
 
 		 414 aa  144  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2837  NnrS  30.89 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0722604  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2741  hypothetical protein  35.79 
 
 		 442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.300362  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0630  hypothetical protein  35.79 
 
 		 407 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446034  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2807  Heme/copper membrane protein  35.79 
 
 		 407 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.817552  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2382  hypothetical protein  35.79 
 
 		 407 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.863987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2905  hypothetical protein  35.79 
 
 		 407 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2683  hypothetical protein  35.79 
 
 		 407 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4999  NnrS  34.47 
 
 		 405 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.441301  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1810  hypothetical protein  34.83 
 
 		 407 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1884  NnrS  32.89 
 
 		 401 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0526931  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2830  hypothetical protein  34.9 
 
 		 409 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002671  NnrS protein  30.63 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1465  NnrS family protein  35.25 
 
 		 409 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185105  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0849  putative ATP synthase F0, A subunit  31.44 
 
 		 428 aa  136  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2181  NnrS  30.26 
 
 		 385 aa  136  7.000000000000001e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0227  NnrS family protein  34.69 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3145  NnrS family protein  33.07 
 
 		 394 aa  134  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0163982  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0686  NnrS family protein  31.76 
 
 		 431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1348  hypothetical protein  29.5 
 
 		 417 aa  127  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3399  hypothetical protein  37.22 
 
 		 403 aa  123  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3288  NnrS family protein  37.53 
 
 		 404 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1475  NnrS family protein  33.59 
 
 		 399 aa  119  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0760953 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3610  NnrS family protein  37.53 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.84805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2560  NnrS family protein  31.22 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12013  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2322  NnrS family protein  29.78 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138032  normal  0.897473 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>