109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4289 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4289  NnrS  100 
 
 
388 aa  757    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6279  NnrS family protein  33.67 
 
 
403 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  0.20499 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0283  hypothetical protein  31.82 
 
 
413 aa  160  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0259  hypothetical protein  31.82 
 
 
413 aa  160  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1673  NnrS family protein  30.83 
 
 
408 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496066  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6821  putative membrane protein, NnrS-like protein  30.5 
 
 
403 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2901  NnrS family protein  30.56 
 
 
414 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4275  NnrS  34.85 
 
 
401 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0557  NnrS  30.75 
 
 
402 aa  144  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.042435  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2105  NnrS family protein  33.99 
 
 
392 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0196977  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3791  NnrS  31.62 
 
 
409 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.527545  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4037  NnrS  31.37 
 
 
408 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2303  hypothetical protein  31.32 
 
 
432 aa  133  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3859  NnrS family protein  33.24 
 
 
391 aa  133  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0648  NnrS  32.89 
 
 
393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86713  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1235  NnrS  31.67 
 
 
403 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00575591  unclonable  0.0000000301222 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0307  NnrS family protein  29.75 
 
 
390 aa  127  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.799454  normal  0.0277833 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1524  NnrS family protein  30.23 
 
 
394 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5672  NnrS family protein  33.33 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1410  NnrS-like protein  29.71 
 
 
399 aa  116  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1119  NnrS  34.38 
 
 
396 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0227  NnrS family protein  30.39 
 
 
390 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2876  NnrS family protein  25.56 
 
 
406 aa  110  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534905  hitchhiker  0.00000000207371 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4283  hypothetical protein  28.87 
 
 
401 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1006  NnrS family protein  32.98 
 
 
389 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0347076  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2574  NnrS family protein  35.19 
 
 
392 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00111099  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0102  hypothetical protein  27.56 
 
 
418 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.139814  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2322  NnrS family protein  28.24 
 
 
390 aa  100  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000140024  normal  0.965133 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0967  NnrS family protein  29.66 
 
 
397 aa  99.8  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03874  Heme/copper membrane protein  27.08 
 
 
400 aa  95.9  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2607  NnrS family protein  30.47 
 
 
395 aa  95.9  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4230  NnrS family protein  29.38 
 
 
404 aa  94.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2398  hypothetical protein  29.19 
 
 
398 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2891  hypothetical protein  29.19 
 
 
398 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00927369  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1711  hypothetical protein  29.19 
 
 
398 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129457  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0614  hypothetical protein  29.19 
 
 
406 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3182  NnrS family protein  29.5 
 
 
396 aa  94  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1798  hypothetical protein  29.55 
 
 
406 aa  93.2  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.425687  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2168  NnrS  29.68 
 
 
384 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1973  NnrS family protein  29.79 
 
 
397 aa  90.1  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2849  NnrS family protein  30.31 
 
 
393 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2805  hypothetical protein  27.52 
 
 
390 aa  89.4  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1409  hypothetical protein  31.46 
 
 
424 aa  88.6  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.922088  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2701  heme/copper membrane protein  29.19 
 
 
398 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2759  hypothetical protein  29.19 
 
 
398 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1910  hypothetical protein  27.39 
 
 
414 aa  88.2  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0849  putative ATP synthase F0, A subunit  25 
 
 
428 aa  87  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2821  Heme/copper membrane protein  29.44 
 
 
398 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0630  Heme/copper membrane protein of NnrS family protein  25.74 
 
 
394 aa  86.7  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3145  NnrS family protein  27.86 
 
 
394 aa  86.3  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0163982  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0918  NnrS  30.97 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.948629  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2840  NnrS family protein  30.64 
 
 
393 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250907  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0328  hypothetical protein  30.96 
 
 
397 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3037  NnrS family protein  25.32 
 
 
403 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.226927  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002671  NnrS protein  26.97 
 
 
394 aa  80.5  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2587  NnrS family protein  26.62 
 
 
390 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16699  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2336  NnrS family protein  27.57 
 
 
401 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00114269  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2847  NnrS family protein  27.58 
 
 
401 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2940  NnrS family protein  30.34 
 
 
393 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1665  NnrS family protein  26.7 
 
 
390 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410131  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03317  hypothetical protein  25.45 
 
 
406 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2677  NnrS family protein  26.57 
 
 
390 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0244063 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3473  NnrS  26.19 
 
 
422 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1288  hypothetical protein  27.37 
 
 
389 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0467877  normal  0.017488 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1680  NnrS family protein  26.13 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3970  NnrS family protein  26.72 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0765  NnrS family protein  22.5 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.960663  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4999  NnrS  28.11 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.441301  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2362  NnrS family protein  24.09 
 
 
403 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000703097  decreased coverage  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1227  NnrS family protein  24.8 
 
 
403 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25611  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1702  NnrS family protein  26.01 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.591488  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3582  NnrS family protein  27.91 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.936992  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2425  NnrS family protein  28.36 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.194019  normal  0.204544 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2495  NnrS family protein  28.36 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0720  putative heme-Cu membrane protein (NnrS)  25 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1810  hypothetical protein  27.93 
 
 
407 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1884  NnrS  29.26 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0526931  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0504  NnrS family protein  25.65 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2741  hypothetical protein  28.57 
 
 
442 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.300362  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0630  hypothetical protein  28.57 
 
 
407 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446034  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2807  Heme/copper membrane protein  28.57 
 
 
407 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.817552  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2382  hypothetical protein  28.57 
 
 
407 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.863987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2905  hypothetical protein  28.57 
 
 
407 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1348  hypothetical protein  22.81 
 
 
417 aa  66.6  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2683  hypothetical protein  28.57 
 
 
407 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0686  NnrS family protein  24.07 
 
 
431 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29660  hypothetical protein  26.4 
 
 
397 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4044  NnrS family protein  27.84 
 
 
504 aa  65.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2560  NnrS family protein  24.81 
 
 
397 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12013  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4727  NnrS  28.83 
 
 
398 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0687  NnrS family protein  23.56 
 
 
403 aa  63.2  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5307  putative heme/copper membrane protein  27.25 
 
 
401 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0853882  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3603  NnrS family protein  24.15 
 
 
403 aa  62  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.147714  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2537  hypothetical protein  26.01 
 
 
388 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2322  NnrS family protein  24.71 
 
 
400 aa  59.7  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138032  normal  0.897473 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1485  NnrS-like protein  24.36 
 
 
356 aa  59.7  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0230809  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2181  NnrS  23.44 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1465  NnrS family protein  26.74 
 
 
409 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185105  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2830  hypothetical protein  27.46 
 
 
409 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2837  NnrS  25.95 
 
 
403 aa  57.8  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0722604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>