123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2876 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2876  NnrS family protein  100 
 
 		 406 aa  800    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534905  hitchhiker  0.00000000207371 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2322  NnrS family protein  61.28 
 
 		 390 aa  487  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000140024  normal  0.965133 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2805  hypothetical protein  57.33 
 
 		 390 aa  444  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2587  NnrS family protein  57.18 
 
 		 390 aa  431  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16699  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1680  NnrS family protein  57.8 
 
 		 390 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1665  NnrS family protein  57.8 
 
 		 390 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410131  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2677  NnrS family protein  57.29 
 
 		 390 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0244063 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1702  NnrS family protein  57.18 
 
 		 390 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.591488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2425  NnrS family protein  58.97 
 
 		 390 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.194019  normal  0.204544 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2495  NnrS family protein  58.97 
 
 		 390 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1288  hypothetical protein  56.15 
 
 		 389 aa  383  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0467877  normal  0.017488 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03874  Heme/copper membrane protein  40.25 
 
 		 400 aa  268  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0630  Heme/copper membrane protein of NnrS family protein  39.39 
 
 		 394 aa  266  7e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3037  NnrS family protein  39.46 
 
 		 403 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.226927  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1227  NnrS family protein  37.22 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25611  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0720  putative heme-Cu membrane protein (NnrS)  36.43 
 
 		 393 aa  244  3e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4283  hypothetical protein  39.95 
 
 		 401 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2849  NnrS family protein  38.79 
 
 		 393 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0504  NnrS family protein  37.38 
 
 		 403 aa  238  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3603  NnrS family protein  36.12 
 
 		 403 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.147714  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2362  NnrS family protein  36.54 
 
 		 403 aa  230  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000703097  decreased coverage  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03317  hypothetical protein  34.41 
 
 		 406 aa  229  9e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0687  NnrS family protein  35.64 
 
 		 403 aa  225  9e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2837  NnrS  37.29 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0722604  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2840  NnrS family protein  39.04 
 
 		 393 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1910  hypothetical protein  35.91 
 
 		 414 aa  216  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002671  NnrS protein  35.82 
 
 		 394 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2168  NnrS  40.41 
 
 		 384 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2607  NnrS family protein  37.01 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0765  NnrS family protein  34.73 
 
 		 409 aa  211  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.960663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1410  NnrS-like protein  36.76 
 
 		 399 aa  209  5e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2940  NnrS family protein  36.52 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3582  NnrS family protein  40.21 
 
 		 391 aa  207  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.936992  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29660  hypothetical protein  41.31 
 
 		 397 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2537  hypothetical protein  41.67 
 
 		 388 aa  206  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1409  hypothetical protein  37.65 
 
 		 424 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.922088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0686  NnrS family protein  37.56 
 
 		 431 aa  199  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0849  putative ATP synthase F0, A subunit  33.01 
 
 		 428 aa  199  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0259  hypothetical protein  35.88 
 
 		 413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0283  hypothetical protein  35.88 
 
 		 413 aa  197  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1673  NnrS family protein  35.9 
 
 		 408 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496066  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2560  NnrS family protein  37.41 
 
 		 397 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12013  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3791  NnrS  35.46 
 
 		 409 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.527545  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0557  NnrS  33.67 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.042435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2901  NnrS family protein  33.93 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2847  NnrS family protein  32.75 
 
 		 401 aa  187  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2336  NnrS family protein  32.75 
 
 		 401 aa  187  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00114269  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1348  hypothetical protein  32.78 
 
 		 417 aa  186  7e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0227  NnrS family protein  38.62 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1884  NnrS  34.47 
 
 		 401 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0526931  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5307  putative heme/copper membrane protein  34.64 
 
 		 401 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0853882  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6279  NnrS family protein  35.36 
 
 		 403 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  0.20499 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3473  NnrS  33.66 
 
 		 422 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3970  NnrS family protein  33.85 
 
 		 398 aa  182  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1235  NnrS  33.9 
 
 		 403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00575591  unclonable  0.0000000301222 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3399  hypothetical protein  35.15 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0614  hypothetical protein  31.62 
 
 		 406 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2398  hypothetical protein  31.68 
 
 		 398 aa  170  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2891  hypothetical protein  31.68 
 
 		 398 aa  170  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00927369  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1711  hypothetical protein  31.68 
 
 		 398 aa  170  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129457  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4727  NnrS  31.47 
 
 		 398 aa  169  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4037  NnrS  34.72 
 
 		 408 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0307  NnrS family protein  30.98 
 
 		 390 aa  166  8e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.799454  normal  0.0277833 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1798  hypothetical protein  31.13 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.425687  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6821  putative membrane protein, NnrS-like protein  32.04 
 
 		 403 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4999  NnrS  35.19 
 
 		 405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.441301  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2701  heme/copper membrane protein  31.68 
 
 		 398 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2759  hypothetical protein  31.68 
 
 		 398 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0102  hypothetical protein  31.43 
 
 		 418 aa  162  9e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.139814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2821  Heme/copper membrane protein  31.44 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3145  NnrS family protein  32.58 
 
 		 394 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0163982  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2303  hypothetical protein  31.9 
 
 		 432 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1475  NnrS family protein  32.27 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0760953 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0648  NnrS  31.89 
 
 		 393 aa  155  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86713  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3182  NnrS family protein  32.14 
 
 		 396 aa  153  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4230  NnrS family protein  34.01 
 
 		 404 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0967  NnrS family protein  31.73 
 
 		 397 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3288  NnrS family protein  33 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2105  NnrS family protein  31.77 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0196977  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2574  NnrS family protein  32.89 
 
 		 392 aa  149  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00111099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2181  NnrS  31.59 
 
 		 385 aa  149  9e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3610  NnrS family protein  33.25 
 
 		 404 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.84805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1524  NnrS family protein  34.57 
 
 		 394 aa  146  6e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4275  NnrS  31.33 
 
 		 401 aa  146  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1006  NnrS family protein  32.98 
 
 		 389 aa  146  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0347076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3859  NnrS family protein  33.85 
 
 		 391 aa  142  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5672  NnrS family protein  32.29 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1119  NnrS  34.34 
 
 		 396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1810  hypothetical protein  31.9 
 
 		 407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2159  NnrS family protein  30.85 
 
 		 398 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0400909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2807  Heme/copper membrane protein  29.62 
 
 		 407 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.817552  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2683  hypothetical protein  30.1 
 
 		 407 aa  123  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2741  hypothetical protein  29.84 
 
 		 442 aa  123  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.300362  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0630  hypothetical protein  29.84 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446034  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2382  hypothetical protein  29.84 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.863987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2905  hypothetical protein  29.84 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1973  NnrS family protein  31.73 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0328  hypothetical protein  32.05 
 
 		 397 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2322  NnrS family protein  30.45 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138032  normal  0.897473 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0928  NnrS family protein  30.27 
 
 		 397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0391816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>