92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1450 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1450  NnrS family protein  100 
 
 		 425 aa  790    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.9412  normal  0.157147 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0494  NnrS family protein  77.99 
 
 		 426 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.506659  normal  0.505655 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4166  NnrS family protein  55.91 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1673  NnrS family protein  30.69 
 
 		 408 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496066  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2901  NnrS family protein  29.07 
 
 		 414 aa  94  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4230  NnrS family protein  33.62 
 
 		 404 aa  92.8  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6821  putative membrane protein, NnrS-like protein  30.26 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3791  NnrS  39.55 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.527545  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0765  NnrS family protein  26.02 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.960663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3473  NnrS  25.64 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1235  NnrS  30.77 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00575591  unclonable  0.0000000301222 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0283  hypothetical protein  28.17 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2876  NnrS family protein  27.72 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534905  hitchhiker  0.00000000207371 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1349  NnrS  26.11 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000146845  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0259  hypothetical protein  27.92 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1808  NnrS family protein  31.58 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193924  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4037  NnrS  29.51 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2105  NnrS family protein  29.04 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0196977  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1555  NnrS family protein  26.17 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000108211  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2805  hypothetical protein  28.4 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03874  Heme/copper membrane protein  38.24 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3970  NnrS family protein  28.9 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0102  hypothetical protein  29.73 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.139814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2574  NnrS family protein  45.45 
 
 		 392 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00111099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0557  NnrS  28.94 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.042435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3859  NnrS family protein  43.96 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1006  NnrS family protein  41.18 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0347076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4275  NnrS  29.2 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0967  NnrS family protein  42.06 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1409  hypothetical protein  35.23 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.922088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5672  NnrS family protein  41.79 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0686  NnrS family protein  32.39 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3182  NnrS family protein  41.05 
 
 		 396 aa  59.7  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1884  NnrS  51.39 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0526931  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1348  hypothetical protein  38.61 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03317  hypothetical protein  41.46 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1680  NnrS family protein  35.91 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002671  NnrS protein  42.68 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2680  NnrS family protein  33.85 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1475  NnrS family protein  32.98 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0760953 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0307  NnrS family protein  42.57 
 
 		 390 aa  55.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.799454  normal  0.0277833 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0720  putative heme-Cu membrane protein (NnrS)  25.45 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6279  NnrS family protein  27.54 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  0.20499 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2587  NnrS family protein  28.86 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16699  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1665  NnrS family protein  35.36 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410131  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2677  NnrS family protein  35.36 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0244063 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0648  NnrS  41.9 
 
 		 393 aa  53.9  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86713  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0504  NnrS family protein  38.18 
 
 		 403 aa  53.9  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0687  NnrS family protein  40 
 
 		 403 aa  53.5  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1810  hypothetical protein  40.65 
 
 		 407 aa  53.1  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2807  Heme/copper membrane protein  39.34 
 
 		 407 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.817552  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3145  NnrS family protein  25.45 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0163982  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1910  hypothetical protein  36.36 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2741  hypothetical protein  39.84 
 
 		 442 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.300362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3037  NnrS family protein  36.05 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.226927  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2607  NnrS family protein  35.38 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2683  hypothetical protein  39.84 
 
 		 407 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0630  hypothetical protein  39.84 
 
 		 407 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446034  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2905  hypothetical protein  39.84 
 
 		 407 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2382  hypothetical protein  39.84 
 
 		 407 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.863987  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1515  NnrS family protein  48.78 
 
 		 409 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329363  normal  0.0719715 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1410  NnrS-like protein  35.06 
 
 		 399 aa  50.4  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2830  hypothetical protein  45.35 
 
 		 409 aa  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1465  NnrS family protein  45.88 
 
 		 409 aa  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185105  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2303  hypothetical protein  50 
 
 		 432 aa  50.1  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2560  NnrS family protein  38.58 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12013  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1524  NnrS family protein  38.03 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0849  putative ATP synthase F0, A subunit  24.19 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2181  NnrS  38.2 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4727  NnrS  42.31 
 
 		 398 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1702  NnrS family protein  40.23 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.591488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2940  NnrS family protein  41.05 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2322  NnrS family protein  28.64 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000140024  normal  0.965133 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2849  NnrS family protein  41.67 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5307  putative heme/copper membrane protein  45.1 
 
 		 401 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0853882  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1288  hypothetical protein  29.95 
 
 		 389 aa  47.4  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0467877  normal  0.017488 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3603  NnrS family protein  38.27 
 
 		 403 aa  47.4  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.147714  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2847  NnrS family protein  35.64 
 
 		 401 aa  46.6  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2362  NnrS family protein  35.8 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000703097  decreased coverage  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2336  NnrS family protein  35.64 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00114269  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2874  NnrS  26.58 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0630  Heme/copper membrane protein of NnrS family protein  21.02 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4044  NnrS family protein  39.58 
 
 		 504 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2837  NnrS  39.51 
 
 		 403 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0722604  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4999  NnrS  43.52 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.441301  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1227  NnrS family protein  41.18 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25611  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0328  hypothetical protein  36.88 
 
 		 397 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4283  hypothetical protein  35.62 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0227  NnrS family protein  40.58 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3582  NnrS family protein  35.33 
 
 		 391 aa  43.5  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.936992  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1973  NnrS family protein  43.33 
 
 		 397 aa  43.1  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0421  integral membrane protein  23.64 
 
 		 368 aa  43.1  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>