12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0421 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0421  integral membrane protein  100 
 
 
368 aa  725    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0283  hypothetical protein  25.4 
 
 
413 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2168  NnrS  25.57 
 
 
384 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4230  NnrS family protein  25.6 
 
 
404 aa  53.1  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4289  NnrS  27.41 
 
 
388 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0259  hypothetical protein  25.08 
 
 
413 aa  52.8  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2901  NnrS family protein  21.79 
 
 
414 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0494  NnrS family protein  23.32 
 
 
426 aa  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.506659  normal  0.505655 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3582  NnrS family protein  23.27 
 
 
391 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.936992  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3182  NnrS family protein  24.58 
 
 
396 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1673  NnrS family protein  25 
 
 
408 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496066  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0557  NnrS  23.87 
 
 
402 aa  43.1  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.042435  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>