24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2179 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2179  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  525  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203025  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3073  hypothetical protein  55.69 
 
 		 299 aa  285  7e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571967 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1648  hypothetical protein  60.89 
 
 		 262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.403485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5009  hypothetical protein  43.32 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4976  hypothetical protein  43.37 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112935  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3184  hypothetical protein  43.37 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4295  hypothetical protein  43.37 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal  0.381726 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5455  hypothetical protein  44.07 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0128  hypothetical protein  43.88 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0774  hypothetical protein  41.2 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2460  hypothetical protein  40.49 
 
 		 258 aa  178  9e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04660  hypothetical protein  37.2 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1964  hypothetical protein  39.92 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2112  hypothetical protein  38.37 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2203  hypothetical protein  39.13 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.120028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1114  hypothetical protein  39.08 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1289  hypothetical protein  35.48 
 
 		 260 aa  168  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3340  hypothetical protein  40.31 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3258  hypothetical protein  39.26 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2671  hypothetical protein  36.99 
 
 		 270 aa  152  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000402711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2418  hypothetical protein  38.21 
 
 		 267 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  0.533481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2488  hypothetical protein  36.59 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2038  hypothetical protein  38.17 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.694865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5564  hypothetical protein  39.27 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>