24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2038 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2038  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  562  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.694865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3258  hypothetical protein  59.92 
 
 		 274 aa  307  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2203  hypothetical protein  57.42 
 
 		 264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.120028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2488  hypothetical protein  54.96 
 
 		 270 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2671  hypothetical protein  54.58 
 
 		 270 aa  301  9e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000402711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2418  hypothetical protein  56.49 
 
 		 267 aa  290  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  0.533481 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0774  hypothetical protein  51.22 
 
 		 256 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1964  hypothetical protein  45.59 
 
 		 261 aa  230  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04660  hypothetical protein  44.05 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2460  hypothetical protein  44.8 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1289  hypothetical protein  41.13 
 
 		 260 aa  206  5e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5009  hypothetical protein  47.7 
 
 		 258 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5455  hypothetical protein  44.49 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3184  hypothetical protein  42.86 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4295  hypothetical protein  42.86 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal  0.381726 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4976  hypothetical protein  42.86 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112935  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0128  hypothetical protein  45.71 
 
 		 257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2112  hypothetical protein  42.15 
 
 		 258 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3073  hypothetical protein  38.43 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571967 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5564  hypothetical protein  41.92 
 
 		 262 aa  168  9e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2179  hypothetical protein  39.46 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203025  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3340  hypothetical protein  36.89 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1648  hypothetical protein  38.43 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.403485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1114  hypothetical protein  41.03 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.218753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>