24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2460 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2460  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  540  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1964  hypothetical protein  66.93 
 
 
261 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0774  hypothetical protein  56.57 
 
 
256 aa  303  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04660  hypothetical protein  48.78 
 
 
258 aa  265  4e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1289  hypothetical protein  44.49 
 
 
260 aa  251  9.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2203  hypothetical protein  46.77 
 
 
264 aa  225  6e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.120028  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2671  hypothetical protein  41.83 
 
 
270 aa  211  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000402711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2488  hypothetical protein  41.83 
 
 
270 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3258  hypothetical protein  45.02 
 
 
274 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780433  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2038  hypothetical protein  44.8 
 
 
274 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.694865  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2418  hypothetical protein  43.9 
 
 
267 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  0.533481 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3073  hypothetical protein  39.68 
 
 
299 aa  201  8e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571967 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4976  hypothetical protein  41.22 
 
 
260 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112935  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3184  hypothetical protein  41.22 
 
 
260 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4295  hypothetical protein  41.22 
 
 
260 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal  0.381726 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3340  hypothetical protein  39.43 
 
 
266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2112  hypothetical protein  40.55 
 
 
258 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5009  hypothetical protein  44.3 
 
 
258 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5455  hypothetical protein  43.93 
 
 
258 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5564  hypothetical protein  39.44 
 
 
262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0128  hypothetical protein  43.42 
 
 
257 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2179  hypothetical protein  40.49 
 
 
259 aa  178  9e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203025  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1648  hypothetical protein  38.93 
 
 
262 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.403485  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1114  hypothetical protein  37.34 
 
 
262 aa  149  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.218753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>