24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2112 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2112  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0128  hypothetical protein  69.32 
 
 
257 aa  361  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5455  hypothetical protein  68.11 
 
 
258 aa  348  4e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5009  hypothetical protein  66.93 
 
 
258 aa  348  7e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4976  hypothetical protein  47.76 
 
 
260 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112935  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3184  hypothetical protein  47.76 
 
 
260 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4295  hypothetical protein  47.76 
 
 
260 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal  0.381726 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3340  hypothetical protein  43.16 
 
 
266 aa  203  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3073  hypothetical protein  40.24 
 
 
299 aa  197  9e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571967 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2203  hypothetical protein  40.55 
 
 
264 aa  193  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.120028  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1964  hypothetical protein  43.61 
 
 
261 aa  192  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3258  hypothetical protein  41.37 
 
 
274 aa  191  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780433  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5564  hypothetical protein  44.63 
 
 
262 aa  190  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04660  hypothetical protein  38.37 
 
 
258 aa  188  7e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2418  hypothetical protein  42.39 
 
 
267 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  0.533481 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2460  hypothetical protein  40.55 
 
 
258 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2671  hypothetical protein  38.96 
 
 
270 aa  186  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000402711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2488  hypothetical protein  39.36 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1289  hypothetical protein  36.25 
 
 
260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2038  hypothetical protein  42.15 
 
 
274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.694865  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0774  hypothetical protein  39.36 
 
 
256 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1648  hypothetical protein  39.92 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.403485  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2179  hypothetical protein  38.37 
 
 
259 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203025  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1114  hypothetical protein  37.97 
 
 
262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.218753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>