24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1114 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1114  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  530  1e-149  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3073  hypothetical protein  39.33 
 
 
299 aa  186  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571967 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04660  hypothetical protein  39.36 
 
 
258 aa  180  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0774  hypothetical protein  40.17 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2418  hypothetical protein  42.49 
 
 
267 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  0.533481 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0128  hypothetical protein  39.67 
 
 
257 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2179  hypothetical protein  39.08 
 
 
259 aa  169  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203025  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5564  hypothetical protein  40.25 
 
 
262 aa  168  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5009  hypothetical protein  39.26 
 
 
258 aa  168  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2112  hypothetical protein  37.97 
 
 
258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1648  hypothetical protein  39.83 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.403485  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3340  hypothetical protein  37.45 
 
 
266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5455  hypothetical protein  37.6 
 
 
258 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2488  hypothetical protein  38.89 
 
 
270 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1964  hypothetical protein  38.31 
 
 
261 aa  158  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2671  hypothetical protein  39.2 
 
 
270 aa  158  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000402711 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1289  hypothetical protein  37.04 
 
 
260 aa  157  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3184  hypothetical protein  36.6 
 
 
260 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4295  hypothetical protein  36.6 
 
 
260 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal  0.381726 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4976  hypothetical protein  36.6 
 
 
260 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112935  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2460  hypothetical protein  37.34 
 
 
258 aa  149  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2203  hypothetical protein  36.67 
 
 
264 aa  149  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.120028  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3258  hypothetical protein  40.87 
 
 
274 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780433  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2038  hypothetical protein  41.03 
 
 
274 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.694865  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>