24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3340 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3340  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  546  1e-155  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2112  hypothetical protein  43.16 
 
 		 258 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0128  hypothetical protein  42.56 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4295  hypothetical protein  42.31 
 
 		 260 aa  198  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal  0.381726 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4976  hypothetical protein  42.31 
 
 		 260 aa  198  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112935  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3184  hypothetical protein  42.31 
 
 		 260 aa  198  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1289  hypothetical protein  37.71 
 
 		 260 aa  198  7.999999999999999e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3073  hypothetical protein  40.86 
 
 		 299 aa  192  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571967 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04660  hypothetical protein  37.55 
 
 		 258 aa  192  5e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2460  hypothetical protein  39.43 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0774  hypothetical protein  41.74 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1964  hypothetical protein  37.5 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5455  hypothetical protein  41.08 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3258  hypothetical protein  40.73 
 
 		 274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2488  hypothetical protein  38.75 
 
 		 270 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2671  hypothetical protein  39.17 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000402711 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5009  hypothetical protein  40.34 
 
 		 258 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5564  hypothetical protein  40.83 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2418  hypothetical protein  39.26 
 
 		 267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  0.533481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2203  hypothetical protein  36.25 
 
 		 264 aa  168  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.120028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2179  hypothetical protein  40.31 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203025  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2038  hypothetical protein  36.89 
 
 		 274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.694865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1114  hypothetical protein  37.45 
 
 		 262 aa  162  6e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1648  hypothetical protein  36.63 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.403485  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>