24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2418 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2418  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  544  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  0.533481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2203  hypothetical protein  58.46 
 
 
264 aa  311  6.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.120028  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2488  hypothetical protein  56.32 
 
 
270 aa  300  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2671  hypothetical protein  56.44 
 
 
270 aa  300  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000402711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3258  hypothetical protein  59 
 
 
274 aa  297  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780433  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2038  hypothetical protein  56.49 
 
 
274 aa  272  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.694865  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0774  hypothetical protein  46.31 
 
 
256 aa  220  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04660  hypothetical protein  39.92 
 
 
258 aa  219  3e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1964  hypothetical protein  44.05 
 
 
261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1289  hypothetical protein  38.89 
 
 
260 aa  204  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2460  hypothetical protein  43.9 
 
 
258 aa  203  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5564  hypothetical protein  42.62 
 
 
262 aa  195  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0128  hypothetical protein  43.92 
 
 
257 aa  189  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2112  hypothetical protein  42.39 
 
 
258 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5009  hypothetical protein  43.88 
 
 
258 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5455  hypothetical protein  40.78 
 
 
258 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4295  hypothetical protein  40.24 
 
 
260 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal  0.381726 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3184  hypothetical protein  40.24 
 
 
260 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4976  hypothetical protein  40.24 
 
 
260 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112935  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3340  hypothetical protein  39.26 
 
 
266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1114  hypothetical protein  42.49 
 
 
262 aa  171  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3073  hypothetical protein  37.45 
 
 
299 aa  169  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571967 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2179  hypothetical protein  38.21 
 
 
259 aa  152  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203025  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1648  hypothetical protein  37.3 
 
 
262 aa  148  8e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.403485  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>