24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2488 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2488  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  560  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2671  hypothetical protein  98.15 
 
 		 270 aa  552  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000402711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3258  hypothetical protein  69.29 
 
 		 274 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2203  hypothetical protein  64.62 
 
 		 264 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.120028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2418  hypothetical protein  56.32 
 
 		 267 aa  300  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  0.533481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2038  hypothetical protein  54.96 
 
 		 274 aa  287  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.694865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0774  hypothetical protein  46.43 
 
 		 256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1964  hypothetical protein  44.67 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2460  hypothetical protein  41.83 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04660  hypothetical protein  41.3 
 
 		 258 aa  205  5e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1289  hypothetical protein  39.52 
 
 		 260 aa  205  5e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5564  hypothetical protein  43.67 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5009  hypothetical protein  42.8 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2112  hypothetical protein  39.36 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3340  hypothetical protein  38.75 
 
 		 266 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4295  hypothetical protein  39.02 
 
 		 260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal  0.381726 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3184  hypothetical protein  39.02 
 
 		 260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4976  hypothetical protein  39.02 
 
 		 260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112935  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5455  hypothetical protein  39.51 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0128  hypothetical protein  40.32 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3073  hypothetical protein  41 
 
 		 299 aa  175  8e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571967 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1648  hypothetical protein  40.09 
 
 		 262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.403485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1114  hypothetical protein  38.89 
 
 		 262 aa  160  3e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2179  hypothetical protein  36.59 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>