244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2554 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2973  Phosphoenolpyruvate carboxylase  49.78 
 
 		 927 aa  748    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2735  Phosphoenolpyruvate carboxylase  60.27 
 
 		 888 aa  879    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0956137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2554  phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 		 875 aa  1743    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0748469  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0974  Phosphoenolpyruvate carboxylase  48 
 
 		 955 aa  703    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000578394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30020  Phosphoenolpyruvate carboxylase  58.31 
 
 		 900 aa  921    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0397  phosphoenolpyruvate carboxylase  63.62 
 
 		 915 aa  1003    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2248  Phosphoenolpyruvate carboxylase  57.38 
 
 		 891 aa  838    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.182119  hitchhiker  0.000536821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0701  phosphoenolpyruvate carboxylase  70.62 
 
 		 890 aa  1134    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1323  Phosphoenolpyruvate carboxylase  70.05 
 
 		 879 aa  1114    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.133852 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0018  phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  46.99 
 
 		 918 aa  724    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0134547 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1398  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.55 
 
 		 917 aa  756    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4129  Phosphoenolpyruvate carboxylase  71.98 
 
 		 892 aa  1142    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54774  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3940  Phosphoenolpyruvate carboxylase  79.98 
 
 		 908 aa  1343    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.622429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3285  Phosphoenolpyruvate carboxylase  56.82 
 
 		 913 aa  857    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.47 
 
 		 931 aa  521  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.28 
 
 		 929 aa  517  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.81 
 
 		 952 aa  501  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.5 
 
 		 938 aa  496  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3806  Phosphoenolpyruvate carboxylase  39.14 
 
 		 907 aa  497  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.589788  normal  0.171928 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.37 
 
 		 906 aa  488  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2311  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.6 
 
 		 900 aa  486  1e-136  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.900921 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.94 
 
 		 933 aa  483  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4375  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.52 
 
 		 896 aa  465  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0553395  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0561  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.83 
 
 		 932 aa  463  1e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.01 
 
 		 939 aa  461  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0472  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.68 
 
 		 898 aa  460  9.999999999999999e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4721  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.69 
 
 		 896 aa  456  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.04 
 
 		 957 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2220  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.96 
 
 		 1018 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0767995 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5805  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.46 
 
 		 914 aa  451  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.454197 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.7 
 
 		 950 aa  449  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000509332 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2522  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.43 
 
 		 898 aa  443  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314131  normal  0.688456 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.43 
 
 		 918 aa  441  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2494  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.57 
 
 		 897 aa  439  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.82 
 
 		 926 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.9 
 
 		 946 aa  439  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1822  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.01 
 
 		 926 aa  439  1e-121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.389962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0994  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.55 
 
 		 892 aa  438  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1138  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.87 
 
 		 926 aa  433  1e-120  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118011  normal  0.338902 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.04 
 
 		 933 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.87 
 
 		 933 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.8 
 
 		 929 aa  431  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2252  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.55 
 
 		 1017 aa  430  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0123033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.97 
 
 		 954 aa  430  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.3 
 
 		 947 aa  432  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2291  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.59 
 
 		 883 aa  432  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0883  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.82 
 
 		 972 aa  429  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.3209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1696  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.61 
 
 		 1017 aa  428  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0836  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.03 
 
 		 1038 aa  428  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.3 
 
 		 1075 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0828  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.05 
 
 		 928 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.891362  normal  0.27066 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.66 
 
 		 920 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.37 
 
 		 936 aa  429  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.4 
 
 		 930 aa  428  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3469  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.62 
 
 		 1024 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4238  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.6 
 
 		 1021 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.4 
 
 		 994 aa  426  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.92 
 
 		 1030 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0261  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.2 
 
 		 882 aa  425  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2647  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.62 
 
 		 1024 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.261414  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1653  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.14 
 
 		 892 aa  423  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0256628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2134  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.68 
 
 		 1023 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  32.56 
 
 		 938 aa  421  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.66 
 
 		 1002 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.81 
 
 		 970 aa  420  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.13 
 
 		 928 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0396  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.23 
 
 		 997 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411219  normal  0.654727 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.8 
 
 		 937 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0871  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.06 
 
 		 1088 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.33 
 
 		 929 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07300  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.87 
 
 		 942 aa  418  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.69 
 
 		 1001 aa  419  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04694  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.98 
 
 		 896 aa  419  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.510612  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1661  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.33 
 
 		 938 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.3 
 
 		 985 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1468  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.19 
 
 		 898 aa  416  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0729  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.82 
 
 		 994 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0699  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.64 
 
 		 1006 aa  416  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1228  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.82 
 
 		 1085 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.774396  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.71 
 
 		 951 aa  413  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2286  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.82 
 
 		 994 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2999  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.82 
 
 		 994 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.82 
 
 		 994 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954175  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1075  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.82 
 
 		 1024 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1599  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.82 
 
 		 994 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.737727  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2335  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.27 
 
 		 998 aa  412  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.361608 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3135  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.07 
 
 		 929 aa  411  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.365231  normal  0.570221 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0304  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.89 
 
 		 931 aa  412  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.66 
 
 		 929 aa  412  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3689  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.15 
 
 		 900 aa  410  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.66 
 
 		 929 aa  411  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  0.000000000174255 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2469  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.86 
 
 		 998 aa  412  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792272  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.72 
 
 		 928 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.47 
 
 		 982 aa  411  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3003  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.18 
 
 		 934 aa  412  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.66 
 
 		 929 aa  411  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2376  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.95 
 
 		 949 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1667  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.7 
 
 		 989 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.21 
 
 		 946 aa  409  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17661  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.22 
 
 		 989 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>