236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3689 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0304  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.95 
 
 		 931 aa  823    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3689  phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 		 900 aa  1824    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.39 
 
 		 931 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2469  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.12 
 
 		 998 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792272  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.42 
 
 		 1001 aa  529  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2335  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.01 
 
 		 998 aa  528  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.361608 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0868  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.17 
 
 		 1004 aa  525  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.17 
 
 		 1002 aa  525  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0699  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.47 
 
 		 1006 aa  520  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1814  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.64 
 
 		 994 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594671  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2426  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.64 
 
 		 1009 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.09 
 
 		 926 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.67 
 
 		 985 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5753  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.75 
 
 		 1008 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.61686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0871  phosphoenolpyruvate carboxylase  38 
 
 		 1088 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.29 
 
 		 929 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2430  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.64 
 
 		 1009 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76585  normal  0.238617 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.8 
 
 		 918 aa  515  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.79 
 
 		 994 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2750  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.03 
 
 		 1009 aa  514  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.06 
 
 		 933 aa  516  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.68 
 
 		 928 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.9 
 
 		 1030 aa  511  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.79 
 
 		 1075 aa  512  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0729  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.75 
 
 		 994 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1228  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.64 
 
 		 1085 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.774396  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2286  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.75 
 
 		 994 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2999  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.75 
 
 		 994 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.75 
 
 		 994 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954175  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1075  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.75 
 
 		 1024 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1599  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.75 
 
 		 994 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.737727  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.26 
 
 		 937 aa  500  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.97 
 
 		 933 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.25 
 
 		 906 aa  500  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.23 
 
 		 936 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.33 
 
 		 929 aa  502  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2376  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.66 
 
 		 949 aa  496  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0561  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.97 
 
 		 932 aa  495  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.55 
 
 		 951 aa  495  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.8 
 
 		 982 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2889  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.55 
 
 		 949 aa  495  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.695135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.35 
 
 		 928 aa  492  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.88 
 
 		 933 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1822  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.91 
 
 		 926 aa  491  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.389962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.33 
 
 		 930 aa  490  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.33 
 
 		 946 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.47 
 
 		 970 aa  487  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.1 
 
 		 929 aa  486  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.55 
 
 		 949 aa  486  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1138  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.79 
 
 		 926 aa  485  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118011  normal  0.338902 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.91 
 
 		 920 aa  484  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.34 
 
 		 946 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.34 
 
 		 946 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.34 
 
 		 946 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1373  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.3 
 
 		 947 aa  482  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333226  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.2 
 
 		 957 aa  482  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1714  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.23 
 
 		 957 aa  482  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.686661  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.9 
 
 		 950 aa  481  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000509332 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1819  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.25 
 
 		 923 aa  477  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2367  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.5 
 
 		 945 aa  479  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.96 
 
 		 947 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0138  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.71 
 
 		 932 aa  476  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.497432 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3003  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.68 
 
 		 934 aa  474  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.12 
 
 		 939 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0178  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.12 
 
 		 940 aa  470  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.39 
 
 		 936 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.15 
 
 		 929 aa  463  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.6 
 
 		 952 aa  466  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.68 
 
 		 938 aa  457  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.48 
 
 		 929 aa  458  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2536  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.03 
 
 		 921 aa  459  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366441  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.48 
 
 		 929 aa  458  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  0.000000000174255 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.51 
 
 		 937 aa  459  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0628  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.77 
 
 		 903 aa  459  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.472091  normal  0.156419 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04694  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.3 
 
 		 896 aa  455  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.510612  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0261  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.22 
 
 		 882 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2291  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.51 
 
 		 883 aa  455  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0883  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.6 
 
 		 972 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.3209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4721  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.31 
 
 		 896 aa  451  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.54 
 
 		 938 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0828  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.49 
 
 		 928 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.891362  normal  0.27066 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07300  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.25 
 
 		 942 aa  443  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2522  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.42 
 
 		 898 aa  443  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314131  normal  0.688456 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4447  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.52 
 
 		 945 aa  444  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0397  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.07 
 
 		 915 aa  444  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16951  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.43 
 
 		 1007 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4375  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.05 
 
 		 896 aa  441  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0553395  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30020  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.07 
 
 		 900 aa  438  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0472  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.3 
 
 		 898 aa  438  1e-121  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5805  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.47 
 
 		 914 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.454197 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3135  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.94 
 
 		 929 aa  434  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.365231  normal  0.570221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2134  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.27 
 
 		 1023 aa  435  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.59 
 
 		 954 aa  429  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2699  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.77 
 
 		 915 aa  429  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2494  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.17 
 
 		 897 aa  430  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3372  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.14 
 
 		 954 aa  432  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16897  normal  0.0169506 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1147  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.73 
 
 		 994 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2220  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.83 
 
 		 1018 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0767995 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3081  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.59 
 
 		 889 aa  427  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.134099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4238  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.07 
 
 		 1021 aa  429  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>