244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1398 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2735  Phosphoenolpyruvate carboxylase  53.37 
 
 
888 aa  866    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0956137  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2554  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.55 
 
 
875 aa  715    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0748469  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0018  phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  81.37 
 
 
918 aa  1532    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0134547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4129  Phosphoenolpyruvate carboxylase  46.8 
 
 
892 aa  714    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54774  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2248  Phosphoenolpyruvate carboxylase  55.46 
 
 
891 aa  917    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.182119  hitchhiker  0.000536821 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1398  phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 
917 aa  1897    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3285  Phosphoenolpyruvate carboxylase  53.6 
 
 
913 aa  883    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0397  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.15 
 
 
915 aa  714    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401912  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1323  Phosphoenolpyruvate carboxylase  47.1 
 
 
879 aa  716    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.133852 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30020  Phosphoenolpyruvate carboxylase  52.24 
 
 
900 aa  890    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2973  Phosphoenolpyruvate carboxylase  65.24 
 
 
927 aa  1174    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0974  Phosphoenolpyruvate carboxylase  63.23 
 
 
955 aa  1150    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000578394  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3940  Phosphoenolpyruvate carboxylase  47.03 
 
 
908 aa  722    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.622429  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0701  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.21 
 
 
890 aa  725    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.78 
 
 
931 aa  426  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3806  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.65 
 
 
907 aa  412  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.589788  normal  0.171928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.06 
 
 
952 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.54 
 
 
938 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.12 
 
 
939 aa  396  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.11 
 
 
957 aa  392  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.22 
 
 
929 aa  387  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1696  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.78 
 
 
1017 aa  387  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  32.54 
 
 
947 aa  386  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2134  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.42 
 
 
1023 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4375  Phosphoenolpyruvate carboxylase  30.6 
 
 
896 aa  381  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0553395  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0304  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.07 
 
 
931 aa  379  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4721  Phosphoenolpyruvate carboxylase  31.26 
 
 
896 aa  377  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.1 
 
 
929 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0561  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.38 
 
 
932 aa  376  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0472  Phosphoenolpyruvate carboxylase  31.53 
 
 
898 aa  370  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  31.64 
 
 
933 aa  372  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0836  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.66 
 
 
1038 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  31.22 
 
 
906 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2311  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.51 
 
 
900 aa  364  4e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.900921 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2252  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.42 
 
 
1017 aa  364  5.0000000000000005e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0123033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.66 
 
 
1001 aa  363  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1822  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.02 
 
 
926 aa  362  2e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.389962  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  31.23 
 
 
946 aa  361  3e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.59 
 
 
954 aa  361  3e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1138  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.57 
 
 
926 aa  360  5e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118011  normal  0.338902 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.34 
 
 
933 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.43 
 
 
985 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.52 
 
 
1002 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3689  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.66 
 
 
900 aa  358  2.9999999999999997e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2494  Phosphoenolpyruvate carboxylase  31.34 
 
 
897 aa  357  3.9999999999999996e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0396  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.5 
 
 
997 aa  357  5e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411219  normal  0.654727 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2522  Phosphoenolpyruvate carboxylase  31.69 
 
 
898 aa  357  7.999999999999999e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314131  normal  0.688456 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  31 
 
 
929 aa  354  5e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17621  phosphoenolpyruvate carboxylase  29.77 
 
 
989 aa  353  8.999999999999999e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04694  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.49 
 
 
896 aa  352  1e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.510612  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0261  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.97 
 
 
882 aa  353  1e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132478  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0994  Phosphoenolpyruvate carboxylase  29.19 
 
 
892 aa  352  2e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43848  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3469  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.01 
 
 
1024 aa  352  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  29.65 
 
 
928 aa  352  2e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1661  Phosphoenolpyruvate carboxylase  30.37 
 
 
938 aa  352  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2647  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.01 
 
 
1024 aa  352  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.261414  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.41 
 
 
928 aa  351  4e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  31.23 
 
 
929 aa  350  6e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  0.000000000174255 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.23 
 
 
929 aa  350  6e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17661  phosphoenolpyruvate carboxylase  29.08 
 
 
989 aa  350  6e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4238  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.57 
 
 
1021 aa  349  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.89 
 
 
926 aa  348  3e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  27.46 
 
 
938 aa  348  3e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17821  phosphoenolpyruvate carboxylase  29.45 
 
 
989 aa  348  3e-94  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22741  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.1 
 
 
1002 aa  348  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.114136 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3135  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.45 
 
 
929 aa  348  4e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.365231  normal  0.570221 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16951  phosphoenolpyruvate carboxylase  29.7 
 
 
1007 aa  347  4e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.68 
 
 
950 aa  347  6e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000509332 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1667  phosphoenolpyruvate carboxylase  29.31 
 
 
989 aa  346  8.999999999999999e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07300  Phosphoenolpyruvate carboxylase  31.17 
 
 
942 aa  346  8.999999999999999e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1653  Phosphoenolpyruvate carboxylase  29.36 
 
 
892 aa  346  1e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0256628  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2291  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.78 
 
 
883 aa  346  1e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.68 
 
 
920 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1147  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.78 
 
 
994 aa  344  5e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.25 
 
 
933 aa  343  7e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20211  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.78 
 
 
994 aa  343  7e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4447  Phosphoenolpyruvate carboxylase  31.52 
 
 
945 aa  342  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  29.38 
 
 
936 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0742  Phosphoenolpyruvate carboxylase  29.76 
 
 
937 aa  340  7e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0707  Phosphoenolpyruvate carboxylase  27.77 
 
 
884 aa  339  9.999999999999999e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  31 
 
 
929 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.03 
 
 
930 aa  339  9.999999999999999e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2220  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.57 
 
 
1018 aa  337  9e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0767995 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0699  phosphoenolpyruvate carboxylase  29.27 
 
 
1006 aa  336  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.59 
 
 
918 aa  335  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1933  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.62 
 
 
995 aa  335  3e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.53 
 
 
946 aa  335  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.53 
 
 
946 aa  335  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.53 
 
 
946 aa  335  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1468  Phosphoenolpyruvate carboxylase  30.18 
 
 
898 aa  333  7.000000000000001e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.48 
 
 
982 aa  333  7.000000000000001e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  29.78 
 
 
951 aa  333  9e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3003  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.62 
 
 
934 aa  332  3e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371181  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0661  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.63 
 
 
831 aa  331  4e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6583  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.14 
 
 
981 aa  330  6e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.800439  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.23 
 
 
937 aa  329  1.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0628  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.6 
 
 
903 aa  329  2.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.472091  normal  0.156419 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.49 
 
 
970 aa  329  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1819  Phosphoenolpyruvate carboxylase  30.7 
 
 
923 aa  328  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0883  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.06 
 
 
972 aa  327  5e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.3209  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>