236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3135 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2430  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.45 
 
 		 1009 aa  723    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76585  normal  0.238617 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.93 
 
 		 1001 aa  736    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.28 
 
 		 985 aa  736    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0729  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.67 
 
 		 994 aa  722    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3135  phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 		 929 aa  1864    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.365231  normal  0.570221 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.51 
 
 		 918 aa  717    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.89 
 
 		 936 aa  721    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0699  phosphoenolpyruvate carboxylase  44.29 
 
 		 1006 aa  726    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.1 
 
 		 928 aa  714    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1228  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.56 
 
 		 1085 aa  719    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.774396  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2335  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.06 
 
 		 998 aa  711    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.361608 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5753  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.24 
 
 		 1008 aa  724    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.61686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.35 
 
 		 949 aa  707    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.49 
 
 		 937 aa  719    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0871  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.02 
 
 		 1088 aa  716    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.55 
 
 		 933 aa  720    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.29 
 
 		 928 aa  706    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1714  phosphoenolpyruvate carboxylase  44.75 
 
 		 957 aa  666    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.686661  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.45 
 
 		 929 aa  722    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.76 
 
 		 970 aa  706    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.01 
 
 		 994 aa  728    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.49 
 
 		 933 aa  711    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.14 
 
 		 929 aa  723    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2750  phosphoenolpyruvate carboxylase  45.45 
 
 		 1009 aa  719    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3081  phosphoenolpyruvate carboxylase  67.12 
 
 		 889 aa  1154    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.134099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1814  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.45 
 
 		 994 aa  723    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594671  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  45.61 
 
 		 946 aa  663    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  50.22 
 
 		 920 aa  759    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0868  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.24 
 
 		 1004 aa  712    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2367  Phosphoenolpyruvate carboxylase  43.95 
 
 		 945 aa  652    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2469  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.17 
 
 		 998 aa  712    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792272  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  45.59 
 
 		 1075 aa  726    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2426  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.45 
 
 		 1009 aa  723    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.13 
 
 		 926 aa  712    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  45.61 
 
 		 946 aa  663    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2376  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.97 
 
 		 949 aa  712    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.99 
 
 		 1002 aa  741    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.34 
 
 		 951 aa  716    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.19 
 
 		 982 aa  702    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2889  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.08 
 
 		 949 aa  713    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.695135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2286  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.67 
 
 		 994 aa  722    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.17 
 
 		 930 aa  673    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1373  phosphoenolpyruvate carboxylase  45.12 
 
 		 947 aa  658    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333226  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.32 
 
 		 950 aa  729    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000509332 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.14 
 
 		 1030 aa  719    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3003  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.29 
 
 		 934 aa  702    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2999  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.67 
 
 		 994 aa  722    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.67 
 
 		 994 aa  722    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954175  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1075  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.67 
 
 		 1024 aa  721    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  45.61 
 
 		 946 aa  663    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1599  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.67 
 
 		 994 aa  722    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.737727  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  43.77 
 
 		 937 aa  640    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1819  Phosphoenolpyruvate carboxylase  47.15 
 
 		 923 aa  706    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218615 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0138  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.8 
 
 		 932 aa  698    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.497432 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2536  Phosphoenolpyruvate carboxylase  43.18 
 
 		 921 aa  629  1e-179  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366441  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0841  Phosphoenolpyruvate carboxylase  45.62 
 
 		 939 aa  626  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  43.8 
 
 		 936 aa  628  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  43.06 
 
 		 905 aa  623  1e-177  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1084  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.74 
 
 		 929 aa  579  1e-164  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0759  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.43 
 
 		 931 aa  568  1e-160  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0707  Phosphoenolpyruvate carboxylase  40.15 
 
 		 884 aa  558  1e-157  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0760  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.89 
 
 		 940 aa  551  1e-155  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.03 
 
 		 906 aa  521  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.34 
 
 		 933 aa  504  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.28 
 
 		 929 aa  500  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.87 
 
 		 938 aa  473  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.3 
 
 		 929 aa  468  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.22 
 
 		 952 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.62 
 
 		 947 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.34 
 
 		 931 aa  465  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0304  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.87 
 
 		 931 aa  451  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.03 
 
 		 946 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.05 
 
 		 938 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0561  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.76 
 
 		 932 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.01 
 
 		 957 aa  444  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1822  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.11 
 
 		 926 aa  444  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.389962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1138  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.01 
 
 		 926 aa  440  9.999999999999999e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118011  normal  0.338902 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.4 
 
 		 939 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0994  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.12 
 
 		 892 aa  441  9.999999999999999e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2252  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.03 
 
 		 1017 aa  435  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0123033 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0248  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.36 
 
 		 887 aa  430  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2134  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.7 
 
 		 1023 aa  429  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0396  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.78 
 
 		 997 aa  427  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411219  normal  0.654727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3372  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.4 
 
 		 954 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16897  normal  0.0169506 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0742  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.18 
 
 		 937 aa  427  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1661  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.39 
 
 		 938 aa  428  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0261  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.11 
 
 		 882 aa  428  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2220  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.86 
 
 		 1018 aa  429  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0767995 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04694  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.65 
 
 		 896 aa  427  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.510612  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0327  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.44 
 
 		 878 aa  425  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.95477 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4214  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.96 
 
 		 889 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1933  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.8 
 
 		 995 aa  425  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4096  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.96 
 
 		 889 aa  426  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2522  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.11 
 
 		 898 aa  425  1e-117  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314131  normal  0.688456 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0254  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.28 
 
 		 887 aa  425  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.974753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4125  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.85 
 
 		 889 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4015  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.96 
 
 		 889 aa  426  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.265986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3689  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.93 
 
 		 900 aa  422  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.53 
 
 		 954 aa  421  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3718  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.81 
 
 		 889 aa  422  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.910029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>