243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4129 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0974  Phosphoenolpyruvate carboxylase  45.9 
 
 		 955 aa  721    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000578394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1398  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.91 
 
 		 917 aa  746    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2554  phosphoenolpyruvate carboxylase  71.98 
 
 		 875 aa  1129    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0748469  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2248  Phosphoenolpyruvate carboxylase  55.13 
 
 		 891 aa  810    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.182119  hitchhiker  0.000536821 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2735  Phosphoenolpyruvate carboxylase  59.49 
 
 		 888 aa  881    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0956137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1323  Phosphoenolpyruvate carboxylase  67.8 
 
 		 879 aa  1096    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.133852 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0018  phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  45.31 
 
 		 918 aa  707    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0134547 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0701  phosphoenolpyruvate carboxylase  70.43 
 
 		 890 aa  1130    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3285  Phosphoenolpyruvate carboxylase  54.63 
 
 		 913 aa  813    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2973  Phosphoenolpyruvate carboxylase  48.96 
 
 		 927 aa  736    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3940  Phosphoenolpyruvate carboxylase  67.94 
 
 		 908 aa  1100    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.622429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0397  phosphoenolpyruvate carboxylase  63.56 
 
 		 915 aa  994    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30020  Phosphoenolpyruvate carboxylase  57.43 
 
 		 900 aa  889    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4129  Phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 		 892 aa  1762    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54774  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.63 
 
 		 931 aa  534  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.3 
 
 		 938 aa  509  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.58 
 
 		 906 aa  509  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.45 
 
 		 929 aa  506  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.04 
 
 		 952 aa  504  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.9 
 
 		 933 aa  486  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3806  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.28 
 
 		 907 aa  480  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.589788  normal  0.171928 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2220  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.34 
 
 		 1018 aa  472  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0767995 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.96 
 
 		 926 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.91 
 
 		 939 aa  464  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2311  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.5 
 
 		 900 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.900921 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.36 
 
 		 1001 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.72 
 
 		 957 aa  456  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4375  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.36 
 
 		 896 aa  456  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0553395  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.12 
 
 		 1002 aa  458  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.1 
 
 		 930 aa  456  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.74 
 
 		 985 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.16 
 
 		 933 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0472  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.21 
 
 		 898 aa  453  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.03 
 
 		 947 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4721  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.43 
 
 		 896 aa  452  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.61 
 
 		 946 aa  452  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.8 
 
 		 933 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.81 
 
 		 950 aa  450  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000509332 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4238  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.31 
 
 		 1021 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2469  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.7 
 
 		 998 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792272  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.33 
 
 		 949 aa  447  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.21 
 
 		 982 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.36 
 
 		 937 aa  444  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0871  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.86 
 
 		 1088 aa  443  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.4 
 
 		 970 aa  446  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1661  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.26 
 
 		 938 aa  446  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2335  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.49 
 
 		 998 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.361608 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17661  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.2 
 
 		 989 aa  445  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2522  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.36 
 
 		 898 aa  442  9.999999999999999e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314131  normal  0.688456 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0699  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.7 
 
 		 1006 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.88 
 
 		 928 aa  442  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1667  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.2 
 
 		 989 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.16 
 
 		 929 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.22 
 
 		 946 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0836  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.13 
 
 		 1038 aa  441  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2376  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.2 
 
 		 949 aa  442  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.22 
 
 		 946 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.2 
 
 		 951 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17821  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.2 
 
 		 989 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17621  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.48 
 
 		 989 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.15 
 
 		 936 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.22 
 
 		 946 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.05 
 
 		 929 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2889  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.09 
 
 		 949 aa  438  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.695135  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0729  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.03 
 
 		 994 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.48 
 
 		 918 aa  436  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1228  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.03 
 
 		 1085 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.774396  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2750  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.38 
 
 		 1009 aa  435  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0261  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.54 
 
 		 882 aa  433  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.63 
 
 		 920 aa  436  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2286  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.03 
 
 		 994 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3003  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.36 
 
 		 934 aa  435  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2999  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.03 
 
 		 994 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.03 
 
 		 994 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954175  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1075  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.03 
 
 		 1024 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1599  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.03 
 
 		 994 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.737727  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.91 
 
 		 929 aa  432  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.91 
 
 		 929 aa  432  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  0.000000000174255 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5753  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.82 
 
 		 1008 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.61686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.37 
 
 		 928 aa  432  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1814  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.96 
 
 		 994 aa  432  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594671  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0868  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.14 
 
 		 1004 aa  432  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0561  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.09 
 
 		 932 aa  432  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1468  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.27 
 
 		 898 aa  430  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2430  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.96 
 
 		 1009 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76585  normal  0.238617 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2426  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.96 
 
 		 1009 aa  432  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6583  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.93 
 
 		 981 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.800439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2291  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.62 
 
 		 883 aa  431  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2367  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.72 
 
 		 945 aa  431  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2134  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.28 
 
 		 1023 aa  429  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3469  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.28 
 
 		 1024 aa  429  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0396  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.74 
 
 		 997 aa  428  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411219  normal  0.654727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5805  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.68 
 
 		 914 aa  429  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.454197 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1696  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.07 
 
 		 1017 aa  427  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.32 
 
 		 994 aa  429  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2647  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.28 
 
 		 1024 aa  429  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.261414  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.16 
 
 		 936 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22741  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.67 
 
 		 1002 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.114136 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.58 
 
 		 1075 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.81 
 
 		 937 aa  429  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>