241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2248 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1398  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.57 
 
 
917 aa  941    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0701  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.16 
 
 
890 aa  822    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2735  Phosphoenolpyruvate carboxylase  67.95 
 
 
888 aa  1064    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0956137  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2554  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.38 
 
 
875 aa  837    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0748469  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3940  Phosphoenolpyruvate carboxylase  55.01 
 
 
908 aa  815    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.622429  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4129  Phosphoenolpyruvate carboxylase  55.25 
 
 
892 aa  804    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54774  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0974  Phosphoenolpyruvate carboxylase  54.03 
 
 
955 aa  891    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000578394  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30020  Phosphoenolpyruvate carboxylase  67.09 
 
 
900 aa  1117    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2973  Phosphoenolpyruvate carboxylase  55 
 
 
927 aa  883    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0397  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.51 
 
 
915 aa  820    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401912  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2248  Phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 
891 aa  1746    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.182119  hitchhiker  0.000536821 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3285  Phosphoenolpyruvate carboxylase  68.74 
 
 
913 aa  1095    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1323  Phosphoenolpyruvate carboxylase  57.05 
 
 
879 aa  834    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.133852 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0018  phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  54.73 
 
 
918 aa  907    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0134547 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.35 
 
 
931 aa  485  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.2 
 
 
952 aa  480  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.51 
 
 
938 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.68 
 
 
1002 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.46 
 
 
950 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000509332 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.72 
 
 
1001 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.41 
 
 
937 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.96 
 
 
947 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.19 
 
 
929 aa  445  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.18 
 
 
985 aa  442  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.55 
 
 
933 aa  437  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4721  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.64 
 
 
896 aa  434  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4375  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.56 
 
 
896 aa  435  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0553395  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1373  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.34 
 
 
947 aa  433  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333226  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.65 
 
 
946 aa  432  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.65 
 
 
946 aa  432  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.65 
 
 
946 aa  432  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1819  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.58 
 
 
923 aa  427  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218615 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.58 
 
 
939 aa  427  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.21 
 
 
951 aa  426  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0699  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.45 
 
 
1006 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2750  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.35 
 
 
1009 aa  423  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251385  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3806  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.44 
 
 
907 aa  426  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.589788  normal  0.171928 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.25 
 
 
920 aa  425  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0729  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.26 
 
 
994 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1228  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.21 
 
 
1085 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.774396  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.23 
 
 
933 aa  422  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.95 
 
 
906 aa  421  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0472  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.37 
 
 
898 aa  422  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2286  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.26 
 
 
994 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2999  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.26 
 
 
994 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.26 
 
 
994 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954175  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1075  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.26 
 
 
1024 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1599  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.26 
 
 
994 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.737727  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.4 
 
 
928 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0871  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.34 
 
 
1088 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.57 
 
 
970 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.88 
 
 
936 aa  419  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2291  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.16 
 
 
883 aa  419  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.67 
 
 
937 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0304  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.54 
 
 
931 aa  415  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3689  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.87 
 
 
900 aa  414  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1661  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.26 
 
 
938 aa  415  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.98 
 
 
936 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.05 
 
 
930 aa  415  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3003  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.53 
 
 
934 aa  414  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371181  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.99 
 
 
949 aa  414  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0561  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.34 
 
 
932 aa  416  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.66 
 
 
1030 aa  412  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2494  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.41 
 
 
897 aa  410  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.66 
 
 
957 aa  411  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5753  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.85 
 
 
1008 aa  412  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.61686  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.08 
 
 
928 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.86 
 
 
954 aa  411  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.84 
 
 
929 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1814  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.58 
 
 
994 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594671  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.8 
 
 
946 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3372  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.49 
 
 
954 aa  406  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16897  normal  0.0169506 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2430  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.58 
 
 
1009 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76585  normal  0.238617 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.55 
 
 
1075 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1138  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.73 
 
 
926 aa  403  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118011  normal  0.338902 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2536  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.06 
 
 
921 aa  404  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2335  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.76 
 
 
998 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.361608 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.37 
 
 
929 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.01 
 
 
994 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.16 
 
 
933 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2376  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.97 
 
 
949 aa  405  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1696  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.77 
 
 
1017 aa  404  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0261  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.24 
 
 
882 aa  404  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132478  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2469  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.97 
 
 
998 aa  406  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792272  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2311  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.71 
 
 
900 aa  405  1e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.900921 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2522  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.73 
 
 
898 aa  404  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314131  normal  0.688456 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2426  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.58 
 
 
1009 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.34 
 
 
982 aa  405  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2889  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.97 
 
 
949 aa  404  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.695135  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0742  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.34 
 
 
937 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.88 
 
 
918 aa  400  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1714  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.09 
 
 
957 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.686661  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.45 
 
 
929 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1822  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.45 
 
 
926 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.389962  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0836  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.32 
 
 
1038 aa  400  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0868  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.54 
 
 
1004 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07300  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.59 
 
 
942 aa  400  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.26 
 
 
929 aa  399  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0396  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.16 
 
 
997 aa  399  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411219  normal  0.654727 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2367  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.75 
 
 
945 aa  397  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>