30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2151 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2151  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 180 aa  355  1.9999999999999998e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174224  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1233  peptidoglycan-binding LysM  42.31 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  hitchhiker  0.00561635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7131  hypothetical protein  37.96 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1478  peptidoglycan-binding LysM  39.81 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00563925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1055  Peptidoglycan-binding LysM  35.04 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1469  peptidoglycan-binding LysM  38.89 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14354  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3815  peptidoglycan-binding LysM  37.7 
 
 		 118 aa  53.9  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473827  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12733  hypothetical protein  34.57 
 
 		 165 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.883536 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1471  Peptidoglycan-binding LysM  36.8 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597219 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1505  Peptidoglycan-binding LysM  37.5 
 
 		 129 aa  52.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000220754 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11460  Peptidoglycan-binding LysM  31.65 
 
 		 120 aa  51.6  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  4.10627e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07340  hypothetical protein  40.54 
 
 		 124 aa  50.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.271335  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1433  Peptidoglycan-binding LysM  43.1 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00640605  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0168  LysM-like protein  31.97 
 
 		 116 aa  48.5  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.140713  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3509  peptidoglycan-binding LysM  43.14 
 
 		 124 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.137678 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3901  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  39.2 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1507  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 147 aa  45.1  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0341474  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0769  Peptidoglycan-binding LysM  36.78 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.352576  normal  0.180452 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0425  peptidoglycan-binding LysM  49.06 
 
 		 334 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0216464  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2432  Peptidoglycan-binding LysM  44.64 
 
 		 116 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.15068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1611  peptidoglycan-binding LysM  49.06 
 
 		 334 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000139366  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23030  LysM domain-containing protein  43.75 
 
 		 147 aa  42.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.14716 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1568  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  37.14 
 
 		 128 aa  42.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208816 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  41.38 
 
 		 310 aa  42.4  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  34.52 
 
 		 304 aa  41.6  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  47.37 
 
 		 128 aa  41.6  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0857  peptidoglycan-binding LysM  48.21 
 
 		 93 aa  41.6  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.555346  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22240  Peptidoglycan-binding LysM  39.58 
 
 		 619 aa  41.2  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2718  Peptidoglycan-binding LysM  29.87 
 
 		 120 aa  41.2  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.12772e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 255 aa  40.8  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>