21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3901 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3901  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  100 
 
 		 213 aa  392  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1469  peptidoglycan-binding LysM  39 
 
 		 166 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14354  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07340  hypothetical protein  40 
 
 		 124 aa  53.9  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.271335  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2151  peptidoglycan-binding LysM  41.41 
 
 		 180 aa  53.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174224  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3815  peptidoglycan-binding LysM  43.88 
 
 		 118 aa  48.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473827  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3978  Peptidoglycan-binding LysM  50.98 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1233  peptidoglycan-binding LysM  38.14 
 
 		 166 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  hitchhiker  0.00561635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7131  hypothetical protein  41.27 
 
 		 129 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11460  Peptidoglycan-binding LysM  23.91 
 
 		 120 aa  45.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  4.10627e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1391  Peptidoglycan-binding LysM  34.04 
 
 		 109 aa  45.4  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000013388  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2718  Peptidoglycan-binding LysM  32.65 
 
 		 120 aa  45.1  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.12772e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0769  Peptidoglycan-binding LysM  26.32 
 
 		 148 aa  44.7  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.352576  normal  0.180452 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1055  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 145 aa  44.3  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1568  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  41.75 
 
 		 128 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208816 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1259  Peptidoglycan-binding LysM  40.82 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.149605  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0857  peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 		 93 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.555346  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1505  Peptidoglycan-binding LysM  29.69 
 
 		 129 aa  43.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000220754 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1471  Peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 		 149 aa  42.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597219 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0789  peptidoglycan-binding LysM  29.47 
 
 		 285 aa  42.4  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  26.32 
 
 		 338 aa  41.2  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0168  LysM-like protein  40.82 
 
 		 116 aa  41.6  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.140713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>