17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0857 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0857  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 93 aa  183  8e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.555346  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3978  Peptidoglycan-binding LysM  59.26 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1505  Peptidoglycan-binding LysM  43.1 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000220754 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11460  Peptidoglycan-binding LysM  30.14 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  4.10627e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07340  hypothetical protein  42.47 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.271335  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0168  LysM-like protein  28.87 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.140713  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0425  peptidoglycan-binding LysM  45.61 
 
 		 334 aa  45.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0216464  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1611  peptidoglycan-binding LysM  45.61 
 
 		 334 aa  45.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000139366  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0573  LysM domain protein  34.48 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0448412 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1568  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  39.29 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3901  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  46 
 
 		 213 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0772  peptidoglycan-binding LysM  34.48 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000768092  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  41.07 
 
 		 289 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2151  peptidoglycan-binding LysM  41.56 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174224  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7131  hypothetical protein  37.5 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3006  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  34.52 
 
 		 103 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.522345  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2542  peptidoglycan-binding LysM  29.49 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0261672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>