23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1233 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1233  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 166 aa  317  7e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  hitchhiker  0.00561635 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1469  peptidoglycan-binding LysM  44.12 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14354  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7131  hypothetical protein  45.83 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2151  peptidoglycan-binding LysM  41.35 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174224  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1055  Peptidoglycan-binding LysM  36.88 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1471  Peptidoglycan-binding LysM  35.65 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597219 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23030  LysM domain-containing protein  44.29 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.14716 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2432  Peptidoglycan-binding LysM  46.43 
 
 		 116 aa  51.6  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.15068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1568  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  44.68 
 
 		 128 aa  48.5  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208816 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1507  peptidoglycan-binding LysM  36.46 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0341474  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07340  hypothetical protein  33.65 
 
 		 124 aa  45.8  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.271335  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0168  LysM-like protein  34.09 
 
 		 116 aa  45.1  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.140713  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11460  Peptidoglycan-binding LysM  29.76 
 
 		 120 aa  45.1  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  4.10627e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0772  peptidoglycan-binding LysM  34.62 
 
 		 95 aa  44.7  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000768092  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0573  LysM domain protein  30.39 
 
 		 125 aa  44.7  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0448412 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0551  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  41.18 
 
 		 377 aa  44.3  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3815  peptidoglycan-binding LysM  36.46 
 
 		 118 aa  42.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473827  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1259  Peptidoglycan-binding LysM  44.83 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.149605  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3509  peptidoglycan-binding LysM  42.22 
 
 		 124 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.137678 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2718  Peptidoglycan-binding LysM  32.73 
 
 		 120 aa  42  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.12772e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  38.6 
 
 		 304 aa  41.2  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  38.89 
 
 		 290 aa  41.2  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1478  peptidoglycan-binding LysM  38.46 
 
 		 104 aa  41.2  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00563925  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>