29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2432 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2432  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 116 aa  220  4.9999999999999996e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.15068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1259  Peptidoglycan-binding LysM  46.85 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.149605  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0772  peptidoglycan-binding LysM  32.22 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000768092  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1469  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14354  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1568  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  55.77 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208816 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23030  LysM domain-containing protein  43.52 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.14716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1233  peptidoglycan-binding LysM  39.6 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  hitchhiker  0.00561635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11460  Peptidoglycan-binding LysM  26 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  4.10627e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3815  peptidoglycan-binding LysM  42.71 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473827  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0573  LysM domain protein  36.26 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0448412 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1237  cell division suppressor protein YneA  27.91 
 
 		 101 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000253866  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1055  Peptidoglycan-binding LysM  35.79 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0168  LysM-like protein  34.78 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.140713  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3955  peptidoglycan-binding LysM  42.17 
 
 		 203 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.574188  normal  0.995266 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2151  peptidoglycan-binding LysM  38.58 
 
 		 180 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174224  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1692  Peptidoglycan-binding LysM  41.82 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000329213  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1505  Peptidoglycan-binding LysM  37.04 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000220754 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2119  cell division suppressor protein YneA  38.37 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2442  peptidoglycan-binding LysM  39.02 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531089  normal  0.113851 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07340  hypothetical protein  35.64 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.271335  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  39 
 
 		 203 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41911  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1471  Peptidoglycan-binding LysM  42.22 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597219 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10630  LysM domain-containing protein  41.18 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.993383  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  34.21 
 
 		 290 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2718  Peptidoglycan-binding LysM  28.16 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.12772e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1507  peptidoglycan-binding LysM  38.54 
 
 		 147 aa  40.8  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0341474  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  42.31 
 
 		 216 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1478  peptidoglycan-binding LysM  33.66 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00563925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0857  peptidoglycan-binding LysM  37.5 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.555346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>