19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1478 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1478  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 104 aa  194  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00563925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2151  peptidoglycan-binding LysM  40.38 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174224  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1469  peptidoglycan-binding LysM  38.68 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14354  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7131  hypothetical protein  36.89 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1233  peptidoglycan-binding LysM  37 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  hitchhiker  0.00561635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11460  Peptidoglycan-binding LysM  30.12 
 
 		 120 aa  50.4  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  4.10627e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1471  Peptidoglycan-binding LysM  40.59 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597219 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3815  peptidoglycan-binding LysM  35.29 
 
 		 118 aa  47.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473827  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1055  Peptidoglycan-binding LysM  36 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07340  hypothetical protein  37.04 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.271335  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3509  peptidoglycan-binding LysM  39.22 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.137678 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1505  Peptidoglycan-binding LysM  34.48 
 
 		 129 aa  42.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000220754 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  35.85 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1507  peptidoglycan-binding LysM  37 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0341474  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  38 
 
 		 208 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2402  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 522 aa  40.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 		 333 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2718  Peptidoglycan-binding LysM  37.5 
 
 		 120 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.12772e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  36.23 
 
 		 255 aa  40  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>