24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3509 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3509  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 124 aa  234  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.137678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1233  peptidoglycan-binding LysM  44.55 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  hitchhiker  0.00561635 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3815  peptidoglycan-binding LysM  41.49 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7131  hypothetical protein  38.66 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1469  peptidoglycan-binding LysM  33.98 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14354  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1055  Peptidoglycan-binding LysM  35.87 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2151  peptidoglycan-binding LysM  37.96 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174224  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1471  Peptidoglycan-binding LysM  35.51 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597219 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11460  Peptidoglycan-binding LysM  27.71 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  4.10627e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0573  LysM domain protein  31.46 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0448412 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3901  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  35.19 
 
 		 213 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  29.49 
 
 		 208 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12733  hypothetical protein  31.25 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.883536 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07340  hypothetical protein  29.27 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.271335  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  31.87 
 
 		 241 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.19 
 
 		 327 aa  42.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  39.22 
 
 		 523 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  32.93 
 
 		 255 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1478  peptidoglycan-binding LysM  29 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00563925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  33.33 
 
 		 239 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0182  Peptidoglycan-binding LysM  40.62 
 
 		 187 aa  40.8  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1568  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  37.5 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208816 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  38.81 
 
 		 285 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0168  LysM-like protein  33.71 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.140713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>