48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1193 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1193  GTPase  100 
 
 		 428 aa  867    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.346231  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  24.66 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  36.78 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2882  GTP-binding protein HSR1-related  38.37 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  33.65 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  23.19 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  23.19 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  33.65 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  33.65 
 
 		 290 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4685  putative GTPase  23.19 
 
 		 294 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  33.65 
 
 		 290 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  31.25 
 
 		 291 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  33.65 
 
 		 290 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3353  GTP-binding protein HSR1-related protein  32.18 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  36.84 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0930  GTP-binding protein HSR1-related  33.33 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.518572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1043  GTP-binding protein HSR1-related protein  33.33 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1071  putative GTPase  34.15 
 
 		 290 aa  57  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0467468 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  39.08 
 
 		 291 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  31.48 
 
 		 650 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  26.27 
 
 		 440 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0043  HSR1-like GTP-binding protein  31.25 
 
 		 578 aa  47  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0375  GTP-binding protein EngA  28.24 
 
 		 483 aa  46.6  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0390  GTP-binding protein EngA  28.24 
 
 		 483 aa  46.6  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.270758  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  31.19 
 
 		 635 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.27 
 
 		 440 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  36.17 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0237  hypothetical protein  38.1 
 
 		 509 aa  45.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04860  septin ring protein, putative  34.09 
 
 		 322 aa  45.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  36.17 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  32.71 
 
 		 455 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0137  tRNA modification GTPase TrmE  35.23 
 
 		 457 aa  44.7  0.003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2089  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.97 
 
 		 637 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000643797  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_002950  PG0876  tRNA modification GTPase TrmE  35.79 
 
 		 518 aa  44.7  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  30.83 
 
 		 456 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  33.7 
 
 		 455 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0488  GTP-binding protein EngA  27.48 
 
 		 483 aa  43.9  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  29.41 
 
 		 456 aa  43.9  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  25.15 
 
 		 398 aa  43.9  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0951  small GTP-binding protein  27.71 
 
 		 201 aa  43.9  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01394  Putative uncharacterized proteinSeptin ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C1M1]  32.58 
 
 		 342 aa  43.9  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6368  tRNA modification GTPase TrmE  33.7 
 
 		 455 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2156  GTP-binding protein Era  27.14 
 
 		 310 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1950  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  26.61 
 
 		 218 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000597271  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  27.22 
 
 		 589 aa  43.1  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0935  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  32 
 
 		 204 aa  43.1  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118155  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10280  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  39.39 
 
 		 201 aa  43.1  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000284353  unclonable  0.00000000129686 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1204  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.94 
 
 		 293 aa  43.1  0.01  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>