100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0043 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0043  HSR1-like GTP-binding protein  100 
 
 
578 aa  1187    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0044  hypothetical protein  54.19 
 
 
463 aa  373  1e-102  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1058  hypothetical protein  44.92 
 
 
746 aa  258  2e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.506927 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1060  hypothetical protein  39.62 
 
 
690 aa  253  5.000000000000001e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.681476 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0045  hypothetical protein  53.85 
 
 
263 aa  240  5e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0451  hypothetical protein  45.3 
 
 
1071 aa  222  1.9999999999999999e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1292  hypothetical protein  42.07 
 
 
562 aa  118  3e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.340896 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  41.89 
 
 
1404 aa  110  5e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1441  hypothetical protein  42 
 
 
1970 aa  103  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0558558 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1221  hypothetical protein  38.82 
 
 
472 aa  102  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0763  hypothetical protein  37.42 
 
 
375 aa  98.6  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  42.75 
 
 
1402 aa  98.2  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  35.29 
 
 
789 aa  96.3  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  40.26 
 
 
1493 aa  95.9  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  34.97 
 
 
684 aa  95.1  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  39.22 
 
 
1585 aa  95.1  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1297  hypothetical protein  39.58 
 
 
342 aa  94.7  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  37.66 
 
 
731 aa  94.4  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  36.73 
 
 
2272 aa  93.2  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1894  hypothetical protein  38.81 
 
 
1244 aa  92.4  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0755541 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1223  hypothetical protein  39.42 
 
 
434 aa  89.7  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000959128 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1120  hypothetical protein  34.27 
 
 
781 aa  87  8e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  37.84 
 
 
961 aa  87  9e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0112  cyclin domain-containing protein  32.7 
 
 
770 aa  84.7  0.000000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1219  hypothetical protein  37.04 
 
 
157 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000377344 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1290  hypothetical protein  38.24 
 
 
1602 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.450967 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  34.04 
 
 
1002 aa  77.4  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  34.78 
 
 
723 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1114  hypothetical protein  38.85 
 
 
162 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.276336 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0228  hypothetical protein  37.31 
 
 
750 aa  74.7  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.871268 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0874  hypothetical protein  44.44 
 
 
100 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  32.06 
 
 
1366 aa  68.2  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  33.56 
 
 
1877 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1912  hypothetical protein  37.38 
 
 
839 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.790758 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1635  hypothetical protein  42.47 
 
 
76 aa  53.9  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  34.44 
 
 
2413 aa  53.5  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  27.27 
 
 
821 aa  53.5  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  25.14 
 
 
2279 aa  52.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1359  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  30.58 
 
 
195 aa  51.6  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.162562  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1327  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  30.58 
 
 
195 aa  50.8  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00220989  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2356  GTP-binding protein EngA  25 
 
 
437 aa  50.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0380  GTPase EngC  35 
 
 
351 aa  48.9  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1746  ribosome-associated GTPase  26.74 
 
 
332 aa  48.1  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2010  ribosome-associated GTPase  39.24 
 
 
349 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1870  ribosome-associated GTPase  37.97 
 
 
349 aa  47.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371283  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1193  GTPase  31.87 
 
 
428 aa  47.4  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.346231  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4625  GTP-binding protein EngA  33.64 
 
 
447 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137577  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2013  GTP-binding protein EngA  24.82 
 
 
437 aa  47  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1436  hypothetical protein  27.36 
 
 
815 aa  47  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0147013 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0617  hypothetical protein  31.37 
 
 
210 aa  45.8  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3299  ribosome-associated GTPase  37.97 
 
 
349 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0506498 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2087  ribosome-associated GTPase  37.97 
 
 
349 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530476  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0728  small GTP-binding protein  26.04 
 
 
441 aa  45.8  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.390352 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0731  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.25 
 
 
367 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.194733  normal  0.466383 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0777  GTP-binding protein EngA  33.33 
 
 
462 aa  45.8  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1673  ribosome-associated GTPase  26.09 
 
 
332 aa  45.4  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1866  ribosome-associated GTPase  37.97 
 
 
364 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1836  ribosome-associated GTPase  37.97 
 
 
364 aa  45.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.472013  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1820  ribosome-associated GTPase  37.97 
 
 
364 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2121  ribosome-associated GTPase  37.97 
 
 
349 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2042  ribosome-associated GTPase  37.97 
 
 
349 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000718459 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  30.56 
 
 
300 aa  45.4  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2085  GTPase  27.08 
 
 
297 aa  45.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  29.66 
 
 
280 aa  45.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4247  GTP-binding protein Era  27.21 
 
 
299 aa  45.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2008  ribosome-associated GTPase  37.97 
 
 
364 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2465  GTP-binding protein Era  27.86 
 
 
311 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13510  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.58 
 
 
367 aa  45.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000813715  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1011  GTP-binding protein Era  27.21 
 
 
299 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262432  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0536  GTP-binding protein EngA  34.71 
 
 
461 aa  45.1  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2203  ribosome-associated GTPase EngA  28.57 
 
 
567 aa  44.7  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0655  GTP-binding protein Era  27.21 
 
 
299 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1135  GTP-binding protein Era  27.21 
 
 
299 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2816  GTP-binding protein Era  28.06 
 
 
299 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.989072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2778  GTP-binding protein Era  28.06 
 
 
299 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2839  GTP-binding protein Era  28.06 
 
 
299 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2894  GTP-binding protein Era  28.06 
 
 
299 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1788  GTP-binding protein Era  28.06 
 
 
299 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2720  hypothetical protein  33.67 
 
 
369 aa  44.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0544  GTP-binding protein Era  28.06 
 
 
299 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439886  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1093  GTP-binding protein Era  27.64 
 
 
287 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1015  GTP-binding protein Era  27.64 
 
 
287 aa  44.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  28.57 
 
 
299 aa  44.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02424  hypothetical protein  32 
 
 
301 aa  44.3  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1102  GTP-binding protein Era  32 
 
 
301 aa  44.3  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0130588  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3802  GTP-binding protein Era  32 
 
 
301 aa  44.3  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2931  GTP-binding protein Era  32 
 
 
301 aa  44.3  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.163008  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2719  GTP-binding protein Era  32 
 
 
301 aa  44.3  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0551516  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1111  GTP-binding protein Era  32 
 
 
301 aa  44.3  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2852  GTP-binding protein Era  32 
 
 
301 aa  44.3  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0251331  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2721  GTP-binding protein Era  32 
 
 
301 aa  44.3  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0036  ribosome-associated GTPase  35.14 
 
 
344 aa  44.3  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02460  GTP-binding protein Era  32 
 
 
301 aa  44.3  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0790  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.62 
 
 
360 aa  43.9  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2244  GTP-binding protein Era  36.25 
 
 
305 aa  43.9  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  41.67 
 
 
300 aa  43.9  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1731  GTP-binding protein Era  27.34 
 
 
299 aa  43.9  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0490  small GTP-binding protein  36.54 
 
 
429 aa  43.9  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2815  ribosome-associated GTPase EngA  27.04 
 
 
478 aa  43.9  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.560303  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001097  GTPase EngC family protein  36.92 
 
 
358 aa  43.5  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.682772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>