62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_2325 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2325  CRISPR-associated Csh2 family protein  100 
 
 
293 aa  596  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0938  CRISPR-associated Csh2 family protein  68.42 
 
 
302 aa  401  1e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2663  CRISPR-associated protein, Csh2 family  56.76 
 
 
301 aa  329  3e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0973  CRISPR-associated protein, Csh2 family  45.22 
 
 
334 aa  247  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15240  CRISPR-associated protein, Csh2 family  46.73 
 
 
302 aa  238  9e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.105097  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2426  CRISPR-associated protein, Csh2 family  45.52 
 
 
319 aa  223  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0614729  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0269  CRISPR-associated Csh2 family protein  47.02 
 
 
314 aa  223  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0770  CRISPR-associated Csh2 family protein  44.07 
 
 
292 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3202  CRISPR-associated Csh2 family protein  39.32 
 
 
305 aa  197  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1072  CRISPR-associated Csh2 family protein  36.34 
 
 
330 aa  195  9e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.618984  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0623  CRISPR-associated protein, Csh2 family  37.58 
 
 
303 aa  194  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0306  CRISPR-associated protein, Csh2 family  39.26 
 
 
318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1184  CRISPR-associated protein, Csh2 family  37.95 
 
 
318 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0639  CRISPR-associated Csh2 family protein  35.64 
 
 
321 aa  177  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00285412  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1019  CRISPR-associated Csh2 family protein  37.71 
 
 
299 aa  175  7e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2834  CRISPR-associated protein, Csh2 family  35.62 
 
 
351 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3331  CRISPR-associated protein, Csh2 family  34.6 
 
 
340 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4290  CRISPR-associated protein, CT1132 family  31.55 
 
 
356 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1453  CRISPR-associated protein, Csh2 family  34.09 
 
 
359 aa  142  5e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1881  CRISPR-associated Csh2 family protein  33.83 
 
 
302 aa  138  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.576122  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1420  CRISPR-associated protein, Csh2 family  33.97 
 
 
313 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0537  CRISPR-associated Csh2 family protein  30.2 
 
 
329 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1292  CRISPR-associated protein, Csh2 family  32.65 
 
 
306 aa  127  3e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2520  hypothetical protein  28.07 
 
 
301 aa  115  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1486  Csd2 family CRISPR-associated protein  32.86 
 
 
326 aa  109  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1067  CRISPR-associated Csh2 family protein  32.21 
 
 
284 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0472036 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0654  CRISPR-associated Csh2 family protein  32.86 
 
 
309 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1298  CRISPR-associated Csh2 family protein  33.18 
 
 
299 aa  106  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.841348  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0236  CRISPR-associated Csd2 family protein  33.66 
 
 
325 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0604  CRISPR-associated Csh2 family protein  33.8 
 
 
293 aa  104  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.520474  normal  0.472142 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02698  crispr-associated protein, Csd2 family  34.47 
 
 
288 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820948  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1005  CRISPR-associated Csd2 family protein  33.33 
 
 
288 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0231  CRISPR-associated Csh2 family protein  30.12 
 
 
291 aa  103  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.748958  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31600  CRISPR-associated protein Csd2  32.58 
 
 
302 aa  102  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1631  CRISPR-associated protein, Csd2 family  33.49 
 
 
312 aa  101  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.835293  normal  0.948126 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1158  CRISPR-associated Csd2 family protein  32.11 
 
 
302 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3382  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr1 family  32.08 
 
 
327 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.860383  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0823  CRISPR-associated protein, Csd2 family  32.71 
 
 
291 aa  97.8  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582934  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0478  hypothetical protein  31.71 
 
 
288 aa  96.7  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2975  CRISPR-associated Csd2 family protein  31.9 
 
 
290 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1938  CRISPR-associated Csh2 family protein  32.74 
 
 
316 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.364907  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0495  CRISPR-associated Csh2 family protein  30.95 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0831  CRISPR-associated Csd2 family protein  31.08 
 
 
317 aa  92.8  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3579  Csd2 family CRISPR-associated protein  30.2 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1480  CRISPR-associated protein, Csd2 family  29.11 
 
 
294 aa  89.4  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1976  CRISPR-associated protein, Csd2 family  31.34 
 
 
299 aa  89.4  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.856064  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3938  CRISPR-associated protein, CT1132 family  25.68 
 
 
316 aa  86.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1974  CRISPR-associated protein, Csd2 family  29 
 
 
317 aa  86.3  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3522  CRISPR-associated Csd2 family protein  28.7 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3648  CRISPR-associated protein, Csd2 family  29.33 
 
 
286 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3344  CRISPR-associated Csh2 family protein  28.43 
 
 
295 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00748339  normal  0.380655 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1726  CRISPR-associated Csd2 family protein  30.06 
 
 
359 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111007  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1660  CRISPR-associated protein, Csd2 family  27.48 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0847  hypothetical protein  25.86 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0795  CRISPR-associated protein TM1801  27.86 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3904  CRISPR-associated Csh2 family protein  25.1 
 
 
294 aa  62  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.264914  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1007  CRISPR-associated Csh2 family protein  26.11 
 
 
280 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.143713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2185  CRISPR-associated protein TM1801  26.45 
 
 
294 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1433  CRISPR-associated Csd2 family protein  41.94 
 
 
366 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.562068  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4332  CRISPR-associated Csd2 family protein  25.21 
 
 
324 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000155089  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0353  hypothetical protein  24.73 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.171823  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1123  hypothetical protein  24.17 
 
 
286 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.011418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>