58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1453 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1453  CRISPR-associated protein, Csh2 family  100 
 
 		 359 aa  728    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2834  CRISPR-associated protein, Csh2 family  67.42 
 
 		 351 aa  474  1e-133  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3331  CRISPR-associated protein, Csh2 family  50.47 
 
 		 340 aa  299  6e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0306  CRISPR-associated protein, Csh2 family  38.26 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3202  CRISPR-associated Csh2 family protein  35.11 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1072  CRISPR-associated Csh2 family protein  35.38 
 
 		 330 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.618984  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2426  CRISPR-associated protein, Csh2 family  37.75 
 
 		 319 aa  170  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0614729  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0938  CRISPR-associated Csh2 family protein  34.74 
 
 		 302 aa  165  9e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1184  CRISPR-associated protein, Csh2 family  35.67 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0269  CRISPR-associated Csh2 family protein  38.87 
 
 		 314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0623  CRISPR-associated protein, Csh2 family  35.14 
 
 		 303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0639  CRISPR-associated Csh2 family protein  34.31 
 
 		 321 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00285412  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2663  CRISPR-associated protein, Csh2 family  34.98 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15240  CRISPR-associated protein, Csh2 family  34.85 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.105097  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2325  CRISPR-associated Csh2 family protein  33.88 
 
 		 293 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1019  CRISPR-associated Csh2 family protein  33.44 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0973  CRISPR-associated protein, Csh2 family  35.03 
 
 		 334 aa  139  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1881  CRISPR-associated Csh2 family protein  30.47 
 
 		 302 aa  132  6.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.576122  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0537  CRISPR-associated Csh2 family protein  27.22 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0770  CRISPR-associated Csh2 family protein  30.95 
 
 		 292 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1292  CRISPR-associated protein, Csh2 family  29.18 
 
 		 306 aa  113  5e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2520  hypothetical protein  29.45 
 
 		 301 aa  113  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1420  CRISPR-associated protein, Csh2 family  27.24 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0604  CRISPR-associated Csh2 family protein  30.57 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.520474  normal  0.472142 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1938  CRISPR-associated Csh2 family protein  34.58 
 
 		 316 aa  98.6  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.364907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02698  crispr-associated protein, Csd2 family  27.7 
 
 		 288 aa  95.1  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820948  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1631  CRISPR-associated protein, Csd2 family  30.64 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.835293  normal  0.948126 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0654  CRISPR-associated Csh2 family protein  31.06 
 
 		 309 aa  91.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1067  CRISPR-associated Csh2 family protein  30.96 
 
 		 284 aa  90.9  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0472036 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31600  CRISPR-associated protein Csd2  30.42 
 
 		 302 aa  90.9  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1005  CRISPR-associated Csd2 family protein  29.11 
 
 		 288 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0823  CRISPR-associated protein, Csd2 family  30.17 
 
 		 291 aa  87.4  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582934  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0831  CRISPR-associated Csd2 family protein  31.12 
 
 		 317 aa  87  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3938  CRISPR-associated protein, CT1132 family  24.85 
 
 		 316 aa  86.3  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4290  CRISPR-associated protein, CT1132 family  24.86 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1158  CRISPR-associated Csd2 family protein  29.44 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2975  CRISPR-associated Csd2 family protein  27.9 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1298  CRISPR-associated Csh2 family protein  28.09 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.841348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1660  CRISPR-associated protein, Csd2 family  26.41 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0478  hypothetical protein  27.97 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0495  CRISPR-associated Csh2 family protein  27.62 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1974  CRISPR-associated protein, Csd2 family  27.24 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3579  Csd2 family CRISPR-associated protein  30.96 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1480  CRISPR-associated protein, Csd2 family  30.38 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0231  CRISPR-associated Csh2 family protein  25.5 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.748958  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1976  CRISPR-associated protein, Csd2 family  31.25 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.856064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1486  Csd2 family CRISPR-associated protein  27.12 
 
 		 326 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0236  CRISPR-associated Csd2 family protein  28.63 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3382  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr1 family  27.85 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.860383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3522  CRISPR-associated Csd2 family protein  25.17 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3344  CRISPR-associated Csh2 family protein  29.27 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00748339  normal  0.380655 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1726  CRISPR-associated Csd2 family protein  30.27 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1433  CRISPR-associated Csd2 family protein  40.74 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.562068  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3904  CRISPR-associated Csh2 family protein  22.59 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.264914  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0847  hypothetical protein  25 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3648  CRISPR-associated protein, Csd2 family  25.89 
 
 		 286 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1007  CRISPR-associated Csh2 family protein  24.48 
 
 		 280 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.143713  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4332  CRISPR-associated Csd2 family protein  22.41 
 
 		 324 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000155089  normal  0.180837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>