24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0353 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0353  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  615  1e-175  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.171823  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3868  CRISPR-associated protein TM1801  36.69 
 
 
307 aa  205  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1123  hypothetical protein  37.62 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.011418  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0398  hypothetical protein  33.89 
 
 
297 aa  143  3e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00253922  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3004  hypothetical protein  34.3 
 
 
310 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.638889 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0661  hypothetical protein  33.95 
 
 
317 aa  137  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.61032  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1807  hypothetical protein  33.44 
 
 
324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1881  CRISPR-associated Csh2 family protein  27.3 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.576122  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2663  CRISPR-associated protein, Csh2 family  23.88 
 
 
301 aa  67  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1072  CRISPR-associated Csh2 family protein  27.5 
 
 
330 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.618984  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3202  CRISPR-associated Csh2 family protein  27.81 
 
 
305 aa  63.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2520  hypothetical protein  26.14 
 
 
301 aa  63.5  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0623  CRISPR-associated protein, Csh2 family  25.93 
 
 
303 aa  60.1  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0938  CRISPR-associated Csh2 family protein  26.26 
 
 
302 aa  59.7  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1019  CRISPR-associated Csh2 family protein  25.89 
 
 
299 aa  59.3  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0231  CRISPR-associated Csh2 family protein  25.91 
 
 
291 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.748958  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2325  CRISPR-associated Csh2 family protein  24.73 
 
 
293 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2426  CRISPR-associated protein, Csh2 family  24.05 
 
 
319 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0614729  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0306  CRISPR-associated protein, Csh2 family  24.08 
 
 
318 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0269  CRISPR-associated Csh2 family protein  22.36 
 
 
314 aa  50.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1184  CRISPR-associated protein, Csh2 family  21.55 
 
 
318 aa  49.3  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0973  CRISPR-associated protein, Csh2 family  26.62 
 
 
334 aa  46.2  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4290  CRISPR-associated protein, CT1132 family  30.05 
 
 
356 aa  45.8  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1292  CRISPR-associated protein, Csh2 family  22.26 
 
 
306 aa  43.5  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>