62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3202 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3202  CRISPR-associated Csh2 family protein  100 
 
 		 305 aa  610  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0639  CRISPR-associated Csh2 family protein  54.46 
 
 		 321 aa  334  9e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00285412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1184  CRISPR-associated protein, Csh2 family  55.08 
 
 		 318 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0623  CRISPR-associated protein, Csh2 family  52.77 
 
 		 303 aa  318  7.999999999999999e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1072  CRISPR-associated Csh2 family protein  53.54 
 
 		 330 aa  317  1e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.618984  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0306  CRISPR-associated protein, Csh2 family  55.19 
 
 		 318 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1019  CRISPR-associated Csh2 family protein  46.64 
 
 		 299 aa  258  8e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1881  CRISPR-associated Csh2 family protein  44.55 
 
 		 302 aa  242  6e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.576122  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1292  CRISPR-associated protein, Csh2 family  46.23 
 
 		 306 aa  235  5.0000000000000005e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0938  CRISPR-associated Csh2 family protein  45.21 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1420  CRISPR-associated protein, Csh2 family  42.81 
 
 		 313 aa  218  8.999999999999998e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2663  CRISPR-associated protein, Csh2 family  44.3 
 
 		 301 aa  199  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2325  CRISPR-associated Csh2 family protein  39.32 
 
 		 293 aa  197  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15240  CRISPR-associated protein, Csh2 family  42.91 
 
 		 302 aa  192  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.105097  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2520  hypothetical protein  36.33 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2426  CRISPR-associated protein, Csh2 family  38.33 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0614729  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1453  CRISPR-associated protein, Csh2 family  35.51 
 
 		 359 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0973  CRISPR-associated protein, Csh2 family  37.66 
 
 		 334 aa  179  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2834  CRISPR-associated protein, Csh2 family  37.78 
 
 		 351 aa  176  6e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0269  CRISPR-associated Csh2 family protein  38.49 
 
 		 314 aa  175  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0770  CRISPR-associated Csh2 family protein  38.85 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0231  CRISPR-associated Csh2 family protein  35.17 
 
 		 291 aa  160  4e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.748958  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0537  CRISPR-associated Csh2 family protein  33.76 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3331  CRISPR-associated protein, Csh2 family  32.84 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3938  CRISPR-associated protein, CT1132 family  31.92 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4290  CRISPR-associated protein, CT1132 family  30.3 
 
 		 356 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1298  CRISPR-associated Csh2 family protein  29.59 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.841348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1067  CRISPR-associated Csh2 family protein  31.77 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0472036 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1005  CRISPR-associated Csd2 family protein  34.56 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2975  CRISPR-associated Csd2 family protein  33.33 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1480  CRISPR-associated protein, Csd2 family  33.69 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02698  crispr-associated protein, Csd2 family  27.53 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820948  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0654  CRISPR-associated Csh2 family protein  31.63 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0478  hypothetical protein  33.02 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1976  CRISPR-associated protein, Csd2 family  32.58 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.856064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1631  CRISPR-associated protein, Csd2 family  31.44 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.835293  normal  0.948126 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0831  CRISPR-associated Csd2 family protein  32.74 
 
 		 317 aa  95.9  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0604  CRISPR-associated Csh2 family protein  29.17 
 
 		 293 aa  95.5  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.520474  normal  0.472142 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31600  CRISPR-associated protein Csd2  26.87 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1158  CRISPR-associated Csd2 family protein  30.41 
 
 		 302 aa  93.6  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1938  CRISPR-associated Csh2 family protein  25.66 
 
 		 316 aa  92.8  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.364907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0236  CRISPR-associated Csd2 family protein  28.5 
 
 		 325 aa  92.8  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1486  Csd2 family CRISPR-associated protein  30.34 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3579  Csd2 family CRISPR-associated protein  32.2 
 
 		 293 aa  89.4  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0495  CRISPR-associated Csh2 family protein  28.84 
 
 		 297 aa  89  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0823  CRISPR-associated protein, Csd2 family  31.94 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582934  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3648  CRISPR-associated protein, Csd2 family  27.92 
 
 		 286 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3382  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr1 family  29.78 
 
 		 327 aa  86.3  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.860383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1007  CRISPR-associated Csh2 family protein  34.36 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.143713  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3344  CRISPR-associated Csh2 family protein  30.7 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00748339  normal  0.380655 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1974  CRISPR-associated protein, Csd2 family  28.27 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3522  CRISPR-associated Csd2 family protein  28.91 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1726  CRISPR-associated Csd2 family protein  27.04 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2185  CRISPR-associated protein TM1801  29.81 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3904  CRISPR-associated Csh2 family protein  28.83 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.264914  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4332  CRISPR-associated Csd2 family protein  26.72 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000155089  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1433  CRISPR-associated Csd2 family protein  27.64 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.562068  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0847  hypothetical protein  22.77 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1660  CRISPR-associated protein, Csd2 family  59.62 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0795  CRISPR-associated protein TM1801  27.88 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0353  hypothetical protein  27.81 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.171823  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1123  hypothetical protein  25.82 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.011418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>