16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3868 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3868  CRISPR-associated protein TM1801  100 
 
 		 307 aa  637    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0353  hypothetical protein  36.69 
 
 		 307 aa  202  6e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.171823  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1807  hypothetical protein  33.95 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0661  hypothetical protein  34.21 
 
 		 317 aa  172  9e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.61032  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3004  hypothetical protein  33.44 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.638889 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0398  hypothetical protein  30.74 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00253922  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1123  hypothetical protein  33.45 
 
 		 286 aa  143  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.011418  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1072  CRISPR-associated Csh2 family protein  25.61 
 
 		 330 aa  52.4  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.618984  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1881  CRISPR-associated Csh2 family protein  30 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.576122  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2663  CRISPR-associated protein, Csh2 family  22.39 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0623  CRISPR-associated protein, Csh2 family  23.91 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1486  Csd2 family CRISPR-associated protein  30.65 
 
 		 326 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3382  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr1 family  30.89 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.860383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15240  CRISPR-associated protein, Csh2 family  24.02 
 
 		 302 aa  43.1  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.105097  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2520  hypothetical protein  29.29 
 
 		 301 aa  42.7  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02698  crispr-associated protein, Csd2 family  27.44 
 
 		 288 aa  42.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>