63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1072 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1072  CRISPR-associated Csh2 family protein  100 
 
 
330 aa  661    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.618984  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0306  CRISPR-associated protein, Csh2 family  63.85 
 
 
318 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1184  CRISPR-associated protein, Csh2 family  60.14 
 
 
318 aa  378  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0639  CRISPR-associated Csh2 family protein  54.97 
 
 
321 aa  346  3e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00285412  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3202  CRISPR-associated Csh2 family protein  53.54 
 
 
305 aa  317  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0623  CRISPR-associated protein, Csh2 family  47.68 
 
 
303 aa  290  3e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1019  CRISPR-associated Csh2 family protein  45.48 
 
 
299 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1292  CRISPR-associated protein, Csh2 family  42.86 
 
 
306 aa  237  2e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1420  CRISPR-associated protein, Csh2 family  41.88 
 
 
313 aa  219  5e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0938  CRISPR-associated Csh2 family protein  39.42 
 
 
302 aa  203  4e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2325  CRISPR-associated Csh2 family protein  36.34 
 
 
293 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2834  CRISPR-associated protein, Csh2 family  36.76 
 
 
351 aa  191  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1881  CRISPR-associated Csh2 family protein  40.66 
 
 
302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.576122  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2663  CRISPR-associated protein, Csh2 family  38.92 
 
 
301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2520  hypothetical protein  37.17 
 
 
301 aa  187  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2426  CRISPR-associated protein, Csh2 family  40.14 
 
 
319 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0614729  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1453  CRISPR-associated protein, Csh2 family  33.54 
 
 
359 aa  176  7e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3331  CRISPR-associated protein, Csh2 family  34.94 
 
 
340 aa  172  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15240  CRISPR-associated protein, Csh2 family  39.41 
 
 
302 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.105097  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0269  CRISPR-associated Csh2 family protein  40.23 
 
 
314 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0973  CRISPR-associated protein, Csh2 family  36.13 
 
 
334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0770  CRISPR-associated Csh2 family protein  40.27 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0537  CRISPR-associated Csh2 family protein  34.71 
 
 
329 aa  162  9e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0231  CRISPR-associated Csh2 family protein  34.59 
 
 
291 aa  144  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.748958  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3938  CRISPR-associated protein, CT1132 family  30.35 
 
 
316 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4290  CRISPR-associated protein, CT1132 family  32.73 
 
 
356 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1067  CRISPR-associated Csh2 family protein  29.07 
 
 
284 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0472036 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1631  CRISPR-associated protein, Csd2 family  30.9 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.835293  normal  0.948126 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0478  hypothetical protein  29.54 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0604  CRISPR-associated Csh2 family protein  31.39 
 
 
293 aa  97.1  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.520474  normal  0.472142 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2975  CRISPR-associated Csd2 family protein  29.02 
 
 
290 aa  95.9  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1976  CRISPR-associated protein, Csd2 family  30.36 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.856064  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1298  CRISPR-associated Csh2 family protein  29.69 
 
 
299 aa  94.4  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.841348  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02698  crispr-associated protein, Csd2 family  27.8 
 
 
288 aa  94  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820948  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0831  CRISPR-associated Csd2 family protein  27.27 
 
 
317 aa  93.2  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1005  CRISPR-associated Csd2 family protein  29.96 
 
 
288 aa  93.2  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1158  CRISPR-associated Csd2 family protein  30.36 
 
 
302 aa  93.2  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1480  CRISPR-associated protein, Csd2 family  28.42 
 
 
294 aa  92  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1938  CRISPR-associated Csh2 family protein  29.3 
 
 
316 aa  91.7  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.364907  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0654  CRISPR-associated Csh2 family protein  31.08 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0823  CRISPR-associated protein, Csd2 family  30.53 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582934  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0236  CRISPR-associated Csd2 family protein  29.13 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0495  CRISPR-associated Csh2 family protein  25.27 
 
 
297 aa  87  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1486  Csd2 family CRISPR-associated protein  29.46 
 
 
326 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31600  CRISPR-associated protein Csd2  25.08 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3382  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr1 family  28.57 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.860383  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1660  CRISPR-associated protein, Csd2 family  29 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1726  CRISPR-associated Csd2 family protein  24.63 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111007  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3579  Csd2 family CRISPR-associated protein  27.16 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3522  CRISPR-associated Csd2 family protein  31.4 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3344  CRISPR-associated Csh2 family protein  25.18 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00748339  normal  0.380655 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1974  CRISPR-associated protein, Csd2 family  25.53 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4332  CRISPR-associated Csd2 family protein  23.91 
 
 
324 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000155089  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3648  CRISPR-associated protein, Csd2 family  28.64 
 
 
286 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0847  hypothetical protein  26.14 
 
 
307 aa  65.9  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0353  hypothetical protein  30 
 
 
307 aa  63.2  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.171823  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3904  CRISPR-associated Csh2 family protein  24.67 
 
 
294 aa  60.5  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.264914  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1007  CRISPR-associated Csh2 family protein  26.19 
 
 
280 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.143713  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0795  CRISPR-associated protein TM1801  26.24 
 
 
286 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1433  CRISPR-associated Csd2 family protein  46.15 
 
 
366 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.562068  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2185  CRISPR-associated protein TM1801  27.06 
 
 
294 aa  55.8  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3868  CRISPR-associated protein TM1801  25.61 
 
 
307 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1123  hypothetical protein  29.85 
 
 
286 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.011418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>